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Identification of long non-coding RNA-based biomarkers of immunotherapy response in Triple-Negative Breast Cancer via liquid biopsy profiling

Descrizione del progetto

L’uso dei biomarcatori dell’RNA per prevedere la risposta all’immunoterapia nel carcinoma mammario

Il carcinoma mammario triplo negativo è privo dei bersagli molecolari sfruttati dalle terapie standard, il che lo rende il sottotipo di carcinoma mammario più difficile da trattare. Gli inibitori dei checkpoint immunitari si sono dimostrati promettenti, ma i tassi di risposta variano notevolmente e mancano biomarcatori predittivi affidabili. Gli RNA lunghi non codificanti sono una classe di molecole regolatrici che influenzano le vie immunitarie e che si sono rivelati potenziali indicatori della sensibilità all’immunoterapia. Sostenuto dal programma di azioni Marie Skłodowska-Curie, il progetto Triple-R si propone di identificare e caratterizzare biomarcatori a base di RNA non codificante lungo in grado di predire la risposta all’immunoterapia nel carcinoma mammario triplo-negativo. L’équipe di ricerca analizzerà il tessuto tumorale e le biopsie liquide per individuare le firme di RNA associate alla sensibilità al trattamento. Secondo le attese, i risultati del progetto contribuiranno a far progredire le strategie di oncologia di precisione per questo sottotipo di tumore aggressivo.

Obiettivo

Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive and lethal subtype of breast cancer, characterized by the absence of estrogen receptor, progesterone receptor and HER2 expression. This lack of molecular targets limits treatment options and highlights the urgent need of novel therapeutic strategies. While immune checkpoint inhibitors (ICIs) targeting the PD-1/PD-L1 axis have shown promise in early-stage TNBC, response rates remain variable and difficult to predict. Recent studies have implicated long non-coding RNAs (lncRNAs) as key regulators of immune-related pathways, suggesting their potential as modulators of immunotherapy sensitivity.

The Triple-R project aims to identify and functionally characterize lncRNA-based biomarkers predictive of response to neoadjuvant immunotherapy in early TNBC. The specific objectives to achieved this are: 1) To compare lncRNA expression profiles, integrating RNA-sequencing data from tumour tissue and liquid biopsy samples —including exosomes, circulating tumour cells and cell-free RNA— collected from patients undergoing treatment. 2) To infer lncRNA expression from cell-free DNA fragmentomics. 3) To characterize the functional role of selected lncRNAs through CRISPR-based knockdown or overexpression in selected TNBC cell lines under ICIs treatment, assessing the impact on cell proliferation and relative fitness. Furthermore, the project will benefit from an international collaboration (Peter MacCallum Cancer Centre, Australia), with complementary results from the BCT 1702-CHARIOT clinical trial that will enhance the robustness and translational relevance of the findings.

The proposal introduces innovative approaches to advance precision oncology, focusing on gene expression profiling via liquid biopsy. By identifying novel potential biomarkers and lncRNA signatures linked to immunotherapy sensitivity, it aims to improve patient stratification and enable more effective, personalized treatment strategies for TNBC.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

Parole chiave

Programma(i)

Argomento(i)

Meccanismo di finanziamento

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Invito a presentare proposte

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Coordinatore

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION DE MALAGA EN BIOMEDICINA Y SALUD
Contributo netto dell'UE
€ 209 914,56
Indirizzo
CALLE SEVERO OCHOA 35, PARQUE TECNOLOGICO DE ANDALUCIA
29590 MALAGA
Spagna
Regione
Sur Andalucía Málaga
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale
Nessun dato