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Identification of long non-coding RNA-based biomarkers of immunotherapy response in Triple-Negative Breast Cancer via liquid biopsy profiling

Projektbeschreibung

Mit RNA-Biomarkern das Ansprechen auf Brustkrebs-Immuntherapie vorhersagen

Beim dreifach negativen Brustkrebs fehlen die molekularen Zielstrukturen, auf die mit Standardtherapien abgezielt wird, weshalb dieser Subtyp die am schwierigsten behandelbare Brustkrebsart ist. Immun-Checkpoint-Inhibitoren erwiesen sich als vielversprechend, doch die Ansprechraten variieren erheblich, und es mangelt an zuverlässigen prädiktiven Biomarkern. Lange nichtkodierende RNA sind eine Klasse regulatorischer Moleküle, die Immunsignalwege beeinflussen und sich als potenzielle Indikatoren der Sensitivität gegenüber einer Immuntherapie herausgestellt haben. Das Team des innerhalb der Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmen unterstützten Projekts Triple-R verfolgt das Ziel, lange nichtkodierende RNA-Biomarker zu finden und zu charakterisieren, die das Ansprechen auf eine Immuntherapie bei dreifach negativem Brustkrebs vorhersagen. Die Forschungsgruppe wird Tumorgewebe und Flüssigbiopsien analysieren, um RNA-Signaturen aufzudecken, die mit der Behandlungsempfindlichkeit verknüpft sind. Erwartungsgemäß werden dank der Projektergebnisse die Präzisionsonkologiestrategien für diesen aggressiven Krebssubtyp vorangebracht.

Ziel

Triple-negative breast cancer (TNBC) is the most aggressive and lethal subtype of breast cancer, characterized by the absence of estrogen receptor, progesterone receptor and HER2 expression. This lack of molecular targets limits treatment options and highlights the urgent need of novel therapeutic strategies. While immune checkpoint inhibitors (ICIs) targeting the PD-1/PD-L1 axis have shown promise in early-stage TNBC, response rates remain variable and difficult to predict. Recent studies have implicated long non-coding RNAs (lncRNAs) as key regulators of immune-related pathways, suggesting their potential as modulators of immunotherapy sensitivity.

The Triple-R project aims to identify and functionally characterize lncRNA-based biomarkers predictive of response to neoadjuvant immunotherapy in early TNBC. The specific objectives to achieved this are: 1) To compare lncRNA expression profiles, integrating RNA-sequencing data from tumour tissue and liquid biopsy samples —including exosomes, circulating tumour cells and cell-free RNA— collected from patients undergoing treatment. 2) To infer lncRNA expression from cell-free DNA fragmentomics. 3) To characterize the functional role of selected lncRNAs through CRISPR-based knockdown or overexpression in selected TNBC cell lines under ICIs treatment, assessing the impact on cell proliferation and relative fitness. Furthermore, the project will benefit from an international collaboration (Peter MacCallum Cancer Centre, Australia), with complementary results from the BCT 1702-CHARIOT clinical trial that will enhance the robustness and translational relevance of the findings.

The proposal introduces innovative approaches to advance precision oncology, focusing on gene expression profiling via liquid biopsy. By identifying novel potential biomarkers and lncRNA signatures linked to immunotherapy sensitivity, it aims to improve patient stratification and enable more effective, personalized treatment strategies for TNBC.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

Schlüsselbegriffe

Programm/Programme

Thema/Themen

Finanzierungsplan

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

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Koordinator

FUNDACION PARA LA INVESTIGACION DE MALAGA EN BIOMEDICINA Y SALUD
Netto-EU-Beitrag
€ 209 914,56
Adresse
CALLE SEVERO OCHOA 35, PARQUE TECNOLOGICO DE ANDALUCIA
29590 MALAGA
Spanien
Region
Sur Andalucía Málaga
Aktivitätstyp
Research Organisations
Links
Gesamtkosten
Keine Daten