Projektbeschreibung
Epigenetik bei HPV-assoziierten Krebserkrankungen
HPV (Humanes Papilloma-Virus)-positiver Oropharynxkrebs ist ein Subtyp von Kopf-Hals-Krebs, dessen Häufigkeit rapide ansteigt und der eher durch eine HPV-Infektion als durch Tabak oder Alkohol verursacht wird. Die Prognose ist zwar im Allgemeinen günstig, ein erheblicher Anteil der Patientenschaft ist jedoch von einem Rückfall betroffen oder entwickelt Metastasen, was auf eine beträchtliche Variabilität im Tumorverhalten hindeutet, die mit den derzeitigen Methoden nicht vorhergesagt werden kann. Mit Unterstützung durch das Marie-Skłodowska-Curie-Maßnahmenprogramm stellt Projekt EPiTOME-M die epigenetischen Mechanismen in den Blickpunkt, die dieser Variabilität zugrunde liegen. Das Forschungsteam wird Einzelzell-DNS-Methylierungsprofile, aus Patientinnen und Patienten gewonnene Organoide und CRISPR-basierte Werkzeuge nutzen, um zelltypspezifische epigenetische Signaturen zu identifizieren. Darüber hinaus werden regulatorische DNS-Strukturen kartiert und der Einfluss der Telomerlänge auf die Immunreaktionen innerhalb des Tumors untersucht. Die Ergebnisse werden die Entdeckung neuer Biomarker ermöglichen und die Stratifizierung der Patientenschaft für eine personalisierte Behandlung verbessern.
Ziel
HPV-positive oropharyngeal squamous cell carcinoma (HPV+ OPSCC) is a rapidly rising, clinically distinct subtype of head and neck cancer. Despite favourable prognosis, 1/3rd of patients relapse and 5–13% develop metastases within 3 years, reflecting marked interpatient and intra-tumoral heterogeneity and thus impacting treatment response. EPiTOME-M aims to address this challenge by identifying the cell of origin and dissecting epigenetic mechanisms driving heterogeneity and immune evasion. Current studies rely on bulk sequencing, which mask cell-type–specific signals and spatial complexity. I will apply sciMET-seq, a single-cell DNA methylation technology to create reference methylomes from normal tonsil and HPV+ OPSCC tissues, to identify lineage-specific epigenetic signatures. Building on this, I will map G-quadruplex (G4) structures—non-canonical DNA elements known to modulate methylation—within differentially methylated regions and test their functional impact using CRISPRi in HPV˖ OPSCC cell lines. Additionally, I will use patient-derived organoids to examine how telomere length influences the tumour immune microenvironment. This multidisciplinary approach—combining epigenomics, telomere biology, and immunology—will yield mechanistic insights into tumour heterogeneity and immune modulation, enabling novel biomarker discovery and precision stratification in HPV˖ OPSCC. The project will foster a two-way knowledge exchange between me and the host institutions, RCSI and secondment host KU Leuven. This includes expertise in DNA methylation and biomarker development, clinical insight and sample access (RCSI), telomere biology expertise (my contribution), and training in single-cell genomics (KU Leuven). Ultimately, by integrating these strengths, the fellowship will empower me to address a critical question in HPV+ OPSCC and establish a strong, independent research profile at the interface of telomere biology, epigenomics, and oncology.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik DNS
- Medizin- und Gesundheitswissenschaften Klinische Medizin Onkologie
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Epigenetik
Sie müssen sich anmelden oder registrieren, um diese Funktion zu nutzen
Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
HAUPTPROGRAMM
Alle im Rahmen dieses Programms finanzierten Projekte anzeigen
Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF
Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigenKoordinator
Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
D02 YN77 DUBLIN 2
Irland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.