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Epigenetic Profiling and Telomere-Orchestrated Mechanisms in HPV+ Oropharyngeal Cancer

Obiettivo

HPV-positive oropharyngeal squamous cell carcinoma (HPV+ OPSCC) is a rapidly rising, clinically distinct subtype of head and neck cancer. Despite favourable prognosis, 1/3rd of patients relapse and 5–13% develop metastases within 3 years, reflecting marked interpatient and intra-tumoral heterogeneity and thus impacting treatment response. EPiTOME-M aims to address this challenge by identifying the cell of origin and dissecting epigenetic mechanisms driving heterogeneity and immune evasion. Current studies rely on bulk sequencing, which mask cell-type–specific signals and spatial complexity. I will apply sciMET-seq, a single-cell DNA methylation technology to create reference methylomes from normal tonsil and HPV+ OPSCC tissues, to identify lineage-specific epigenetic signatures. Building on this, I will map G-quadruplex (G4) structures—non-canonical DNA elements known to modulate methylation—within differentially methylated regions and test their functional impact using CRISPRi in HPV˖ OPSCC cell lines. Additionally, I will use patient-derived organoids to examine how telomere length influences the tumour immune microenvironment. This multidisciplinary approach—combining epigenomics, telomere biology, and immunology—will yield mechanistic insights into tumour heterogeneity and immune modulation, enabling novel biomarker discovery and precision stratification in HPV˖ OPSCC. The project will foster a two-way knowledge exchange between me and the host institutions, RCSI and secondment host KU Leuven. This includes expertise in DNA methylation and biomarker development, clinical insight and sample access (RCSI), telomere biology expertise (my contribution), and training in single-cell genomics (KU Leuven). Ultimately, by integrating these strengths, the fellowship will empower me to address a critical question in HPV+ OPSCC and establish a strong, independent research profile at the interface of telomere biology, epigenomics, and oncology.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Programma(i)

Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito di questo schema di finanziamento

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

(si apre in una nuova finestra) HORIZON-MSCA-2025-PF

Vedi tutti i progetti finanziati nell’ambito del bando

Coordinatore

ROYAL COLLEGE OF SURGEONS IN IRELAND
Contributo netto dell'UE

Contributo finanziario netto dell’UE. La somma di denaro che il partecipante riceve, decurtata dal contributo dell’UE alla terza parte collegata. Tiene conto della distribuzione del contributo finanziario dell’UE tra i beneficiari diretti del progetto e altri tipi di partecipanti, come i partecipanti terzi.

€ 268 568,64
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Partner (1)

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