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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Dynamics of enhancer-promoter communication and transcription in mouse pseudo-embryos

Descripción del proyecto

Perspectivas sobre la regulación de la expresión génica durante el desarrollo

El desarrollo de un organismo complejo a partir de un único óvulo fecundado requiere que miles de genes se activen y desactiven siguiendo secuencias precisas en el espacio y en el tiempo. Ello viene determinado por elementos reguladores del ADN denominados «potenciadores», que interactúan con genes situados a grandes distancias genómicas. Aún no se conoce bien cómo se establece y se mantiene esta comunicación durante el desarrollo. Con el apoyo de las acciones Marie Skłodowska-Curie, el proyecto TempoEP tiene como objetivo investigar los mecanismos que controlan la comunicación entre los potenciadores y los genes durante la embriogénesis de los mamíferos. Mediante la combinación de tecnologías genómicas y de imagen, los investigadores trazarán un mapa de cómo interactúan los elementos reguladores durante el desarrollo y cómo esto se traduce en la expresión génica.

Objetivo

Embryonic development requires the coordinated execution of sequential gene expression programmes in space and time. This complex regulation is achieved by enhancers, cis-regulatory elements that relay spatiotemporal regulatory information to target promoter(s) in response to transcription factor (TF) binding. While enhancers (E) and promoters (P) are often separated by large linear genomic distances, they can come into close 3D proximity through E-P contacts. However, the mechanisms regulating the temporal dynamics of E-P communication and transcription remain elusive. In the nucleus, chromatin is folded by loop extrusion; disrupting this process abrogates large-scale architecture, yet has only minor effects on E-P contacts and gene expression. Also, the contribution of TFs bound at enhancers and promoters to E-P communication is still unclear. Importantly, previous studies mostly investigated these mechanisms in model systems where chromatin structure and transcription are at steady state, thus neglecting their dynamics. This proposal aims to investigate the causal role of loop extrusion and TF binding in the temporal dynamics of E-P communication and transcription during mammalian embryogenesis, using gastruloids (cultured pseudo-embryos) as a paradigm. This will be achieved through two objectives: (1) mapping how E-P contacts, TF occupancy and transcription evolve over developmental time; and (2) perturbing loop extrusion and TF occupancy with targeted protein degradation at specific developmental time windows. As a readout, I will combine genomic and imaging technologies. Genomics will provide a genome-wide view of changes in E-P contacts and transcription averaged across cells, while imaging will determine at selected loci whether these changes co-occur within individual nuclei. The mechanistic insights revealed by this dual approach will have broad implications for understanding gene regulation in both physiological and pathological developmental processes.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Ver todos los proyectos financiados en el marco de este régimen de financiación

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

(se abrirá en una nueva ventana) HORIZON-MSCA-2025-PF

Ver todos los proyectos financiados en el marco de esta convocatoria

Coordinador

COLLEGE DE FRANCE
Aportación neta de la UEn

Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.

€ 226 420,56
Dirección
PLACE MARCELIN BERTHELOT 11
75005 PARIS
Francia

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Región
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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