Description du projet
Mieux comprendre la régulation de l’expression génique au cours du développement
Le développement d’un organisme complexe à partir d’un simple ovule fécondé requiert l’activation et la désactivation de milliers de gènes selon des séquences précises, tant dans l’espace que dans le temps. Ce processus est orchestré par des éléments régulateurs de l’ADN, qui interagissent avec des gènes situés à de grandes distances les uns des autres sur le génome. La manière dont cette communication s’établit et se maintient au cours du développement, demeure assez floue. Avec le soutien du programme Actions Marie Skłodowska-Curie, le projet TempoEP va étudier les mécanismes régissant la communication entre les régulateurs de l’ADN et les gènes au cours de l’embryogenèse chez les mammifères. En associant les technologies génomiques et d’imagerie, les chercheurs vont cartographier la manière dont les éléments régulateurs interagissent au cours du développement et son incidence sur l'expression génétique.
Objectif
Embryonic development requires the coordinated execution of sequential gene expression programmes in space and time. This complex regulation is achieved by enhancers, cis-regulatory elements that relay spatiotemporal regulatory information to target promoter(s) in response to transcription factor (TF) binding. While enhancers (E) and promoters (P) are often separated by large linear genomic distances, they can come into close 3D proximity through E-P contacts. However, the mechanisms regulating the temporal dynamics of E-P communication and transcription remain elusive. In the nucleus, chromatin is folded by loop extrusion; disrupting this process abrogates large-scale architecture, yet has only minor effects on E-P contacts and gene expression. Also, the contribution of TFs bound at enhancers and promoters to E-P communication is still unclear. Importantly, previous studies mostly investigated these mechanisms in model systems where chromatin structure and transcription are at steady state, thus neglecting their dynamics. This proposal aims to investigate the causal role of loop extrusion and TF binding in the temporal dynamics of E-P communication and transcription during mammalian embryogenesis, using gastruloids (cultured pseudo-embryos) as a paradigm. This will be achieved through two objectives: (1) mapping how E-P contacts, TF occupancy and transcription evolve over developmental time; and (2) perturbing loop extrusion and TF occupancy with targeted protein degradation at specific developmental time windows. As a readout, I will combine genomic and imaging technologies. Genomics will provide a genome-wide view of changes in E-P contacts and transcription averaged across cells, while imaging will determine at selected loci whether these changes co-occur within individual nuclei. The mechanistic insights revealed by this dual approach will have broad implications for understanding gene regulation in both physiological and pathological developmental processes.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques biologie du développement
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) HORIZON-MSCA-2025-PF
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
75005 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.