Opis projektu
Wgląd w regulację ekspresji genów w trakcie rozwoju
Rozwój złożonego organizmu z pojedynczej zapłodnionej komórki jajowej wymaga aktywacji i dezaktywacji tysięcy genów w ściśle określonej kolejności w czasie i przestrzeni. Proces ten jest regulowany przez wzmacniacze transkrypcji – elementy DNA, które oddziałują z genami położonymi w dużych odległościach genomowych. Wciąż jednak niewiele wiadomo, jak ta komunikacja jest nawiązywana i utrzymywana w trakcie rozwoju. Zespół projektu TempoEP, realizowanego przy wsparciu z działań „Maria Skłodowska-Curie”, zbada mechanizmy regulujące komunikację między wzmacniaczami transkrypcji a genami podczas embriogenezy ssaków. Łącząc technologie genomiczne i obrazowe, badacze opracują mapę interakcji elementów regulacyjnych w trakcie rozwoju oraz ustalą, w jaki sposób te interakcje przekładają się na ekspresję genów.
Cel
Embryonic development requires the coordinated execution of sequential gene expression programmes in space and time. This complex regulation is achieved by enhancers, cis-regulatory elements that relay spatiotemporal regulatory information to target promoter(s) in response to transcription factor (TF) binding. While enhancers (E) and promoters (P) are often separated by large linear genomic distances, they can come into close 3D proximity through E-P contacts. However, the mechanisms regulating the temporal dynamics of E-P communication and transcription remain elusive. In the nucleus, chromatin is folded by loop extrusion; disrupting this process abrogates large-scale architecture, yet has only minor effects on E-P contacts and gene expression. Also, the contribution of TFs bound at enhancers and promoters to E-P communication is still unclear. Importantly, previous studies mostly investigated these mechanisms in model systems where chromatin structure and transcription are at steady state, thus neglecting their dynamics. This proposal aims to investigate the causal role of loop extrusion and TF binding in the temporal dynamics of E-P communication and transcription during mammalian embryogenesis, using gastruloids (cultured pseudo-embryos) as a paradigm. This will be achieved through two objectives: (1) mapping how E-P contacts, TF occupancy and transcription evolve over developmental time; and (2) perturbing loop extrusion and TF occupancy with targeted protein degradation at specific developmental time windows. As a readout, I will combine genomic and imaging technologies. Genomics will provide a genome-wide view of changes in E-P contacts and transcription averaged across cells, while imaging will determine at selected loci whether these changes co-occur within individual nuclei. The mechanistic insights revealed by this dual approach will have broad implications for understanding gene regulation in both physiological and pathological developmental processes.
Dziedzina nauki (EuroSciVoc)
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
Klasyfikacja projektów w serwisie CORDIS opiera się na wielojęzycznej taksonomii EuroSciVoc, obejmującej wszystkie dziedziny nauki, w oparciu o półautomatyczny proces bazujący na technikach przetwarzania języka naturalnego. Więcej informacji: Europejski Słownik Naukowy.
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne genetyka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biochemia biocząsteczki białka
- nauki przyrodnicze nauki biologiczne biologia rozwoju
Aby użyć tej funkcji, musisz się zalogować lub zarejestrować
Słowa kluczowe
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Słowa kluczowe dotyczące projektu wybrane przez koordynatora projektu. Nie należy mylić ich z pojęciami z taksonomii EuroSciVoc dotyczącymi dziedzin nauki.
Program(-y)
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
Wieloletnie programy finansowania, które określają priorytety Unii Europejskiej w obszarach badań naukowych i innowacji.
-
HORIZON.1.2 - Marie Skłodowska-Curie Actions (MSCA)
GŁÓWNY PROGRAM
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu
Temat(-y)
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
Zaproszenia do składania wniosków dzielą się na tematy. Każdy temat określa wybrany obszar lub wybrane zagadnienie, których powinny dotyczyć wnioski składane przez wnioskodawców. Opis tematu obejmuje jego szczegółowy zakres i oczekiwane oddziaływanie finansowanego projektu.
System finansowania
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
Program finansowania (lub „rodzaj działania”) realizowany w ramach programu o wspólnych cechach. Określa zakres finansowania, stawkę zwrotu kosztów, szczegółowe kryteria oceny kwalifikowalności kosztów w celu ich finansowania oraz stosowanie uproszczonych form rozliczania kosztów, takich jak rozliczanie ryczałtowe.
HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego programu finansowania
Zaproszenie do składania wniosków
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
Procedura zapraszania wnioskodawców do składania wniosków projektowych w celu uzyskania finansowania ze środków Unii Europejskiej.
(odnośnik otworzy się w nowym oknie) HORIZON-MSCA-2025-PF
Wyświetl wszystkie projekty finansowane w ramach tego zaproszeniaKoordynator
Kwota netto dofinansowania ze środków Unii Europejskiej. Suma środków otrzymanych przez uczestnika, pomniejszona o kwotę unijnego dofinansowania przekazanego powiązanym podmiotom zewnętrznym. Uwzględnia podział unijnego dofinansowania pomiędzy bezpośrednich beneficjentów projektu i pozostałych uczestników, w tym podmioty zewnętrzne.
75005 PARIS
Francja
Ogół kosztów poniesionych przez organizację w związku z uczestnictwem w projekcie. Obejmuje koszty bezpośrednie i pośrednie. Kwota stanowi część całkowitego budżetu projektu.