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Repeat variants shaping disease risk in FinnGen and Estonian Biobank cohorts

Ziel

A substantial proportion of the human genome consists of repetitive content, until recently discarded as “junk DNA”. These include tandem repeats (TRs)—stretches of short sequence motifs repeated consecutively—and mobile elements (MEs), or interspersed repeats capable of replicating and inserting themselves into new genomic locations. Despite their abundance and likely major contribution to disease, repeat variants have been largely neglected in genetic association studies, primarily due to the limited resolution of standard discovery and genotyping methods.

The aim of my MSCA Postdoctoral Fellowship project is to systematically detect and characterise the effects of repeat variants on human traits and diseases. To make TRs and MEs accessible in large population biobanks with mainly microarray data available, I will develop an advanced haplotype-informed framework for repeat variant discovery and imputation, applying it to FinnGen and Estonian Biobank—two cohorts distinguished by exceptionally high population representation and dense familial relatedness in Europe. In the Estonian Biobank specifically, I will leverage long-read sequencing data to construct what will be, to my knowledge, the most comprehensive reference panel of repeat variants to date. The imputed variants will then undergo association testing with rich registry-linked phenotypic data.

Given the overall scarcity of repeat-focused studies at biobank-scale, this project is well positioned to uncover a substantial number of previously unreported phenotype associations. By filling this gap, the project has the potential to deliver novel biological insights into how repeat variants influence human traits and diseases, leading to improved risk prediction and population health.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Programm/Programme

Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

HORIZON-TMA-MSCA-PF-EF - HORIZON TMA MSCA Postdoctoral Fellowships - European Fellowships

Alle im Rahmen dieses Finanzierungsinstruments finanzierten Projekte anzeigen

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

(öffnet in neuem Fenster) HORIZON-MSCA-2025-PF

Alle im Rahmen dieser Aufforderung zur Einreichung von Vorschlägen finanzierten Projekte anzeigen

Koordinator

HELSINGIN YLIOPISTO
Netto-EU-Beitrag

Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.

€ 242 116,80
Adresse
FABIANINKATU 33
00014 HELSINGIN YLIOPISTO
Finnland

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Aktivitätstyp
Higher or Secondary Education Establishments
Links
Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
Mein Booklet 0 0