Objetivo
ATP-dependent chromatin remodelling enzymes (CREs) are central regulators of genome function. By repositioning nucleosomes, they control access to DNA and thereby regulate transcription, replication, and DNA repair. Mutations in CREs are frequent drivers of neurological disorders, developmental syndromes, and cancer. Yet, despite their medical relevance, we still lack a systematic understanding of the specific nucleosome positioning functions of individual human CREs and the factors that regulate their recruitment and activity.
This knowledge gap is especially pronounced for the diverse CHD and ISWI families, which together comprise nearly 20 human remodelling enzymes. To address this, I will establish a chromosome-wide chromatin reconstitution system based on a human BAC library that enables systematic dissection of CRE function on native DNA substrates. First, I will identify CHD and ISWI interactions with transcription factors through AI-based predictions and in vivo proteomics followed by a profound characterization in vitro. Second, I will use purified CHD and ISWI enzymes to determine their precise nucleosome positioning functions using the reconstitution system followed by MNase-seq and single-molecule methylation footprinting (Fiber-seq). Third, I will reconstitute CRE recruitment through epigenetic modifications using our reconstitution system to investigate how epigenetic cues influence nucleosome positioning.
By combining an innovative chromatin reconstitution system with cutting-edge sequencing approaches and AI-driven discovery, vitroCHROM will deliver the first comprehensive picture of human CHD and ISWI remodeller function and recruitment. This compendium will uncover fundamental principles of the regulatory mechanisms that drive nucleosome positioning and establish the long-missing mechanistic framework needed to interpret how CRE malfunction causes human disease.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMA PRINCIPAL
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
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(se abrirá en una nueva ventana) ERC-2026-STG
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Aportación financiera neta de la UE. Es la suma de dinero que recibe el participante, deducida la aportación de la UE a su tercero vinculado. Considera la distribución de la aportación financiera de la UE entre los beneficiarios directos del proyecto y otros tipos de participantes, como los terceros participantes.
37075 Goettingen
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.