Objectif
ATP-dependent chromatin remodelling enzymes (CREs) are central regulators of genome function. By repositioning nucleosomes, they control access to DNA and thereby regulate transcription, replication, and DNA repair. Mutations in CREs are frequent drivers of neurological disorders, developmental syndromes, and cancer. Yet, despite their medical relevance, we still lack a systematic understanding of the specific nucleosome positioning functions of individual human CREs and the factors that regulate their recruitment and activity.
This knowledge gap is especially pronounced for the diverse CHD and ISWI families, which together comprise nearly 20 human remodelling enzymes. To address this, I will establish a chromosome-wide chromatin reconstitution system based on a human BAC library that enables systematic dissection of CRE function on native DNA substrates. First, I will identify CHD and ISWI interactions with transcription factors through AI-based predictions and in vivo proteomics followed by a profound characterization in vitro. Second, I will use purified CHD and ISWI enzymes to determine their precise nucleosome positioning functions using the reconstitution system followed by MNase-seq and single-molecule methylation footprinting (Fiber-seq). Third, I will reconstitute CRE recruitment through epigenetic modifications using our reconstitution system to investigate how epigenetic cues influence nucleosome positioning.
By combining an innovative chromatin reconstitution system with cutting-edge sequencing approaches and AI-driven discovery, vitroCHROM will deliver the first comprehensive picture of human CHD and ISWI remodeller function and recruitment. This compendium will uncover fundamental principles of the regulatory mechanisms that drive nucleosome positioning and establish the long-missing mechanistic framework needed to interpret how CRE malfunction causes human disease.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
PROGRAMME PRINCIPAL
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
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HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
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(s’ouvre dans une nouvelle fenêtre) ERC-2026-STG
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La contribution financière nette de l’UE est la somme d’argent que le participant reçoit, déduite de la contribution de l’UE versée à son tiers lié. Elle prend en compte la répartition de la contribution financière de l’UE entre les bénéficiaires directs du projet et d’autres types de participants, tels que les participants tiers.
37075 Goettingen
Allemagne
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.