Ziel
ATP-dependent chromatin remodelling enzymes (CREs) are central regulators of genome function. By repositioning nucleosomes, they control access to DNA and thereby regulate transcription, replication, and DNA repair. Mutations in CREs are frequent drivers of neurological disorders, developmental syndromes, and cancer. Yet, despite their medical relevance, we still lack a systematic understanding of the specific nucleosome positioning functions of individual human CREs and the factors that regulate their recruitment and activity.
This knowledge gap is especially pronounced for the diverse CHD and ISWI families, which together comprise nearly 20 human remodelling enzymes. To address this, I will establish a chromosome-wide chromatin reconstitution system based on a human BAC library that enables systematic dissection of CRE function on native DNA substrates. First, I will identify CHD and ISWI interactions with transcription factors through AI-based predictions and in vivo proteomics followed by a profound characterization in vitro. Second, I will use purified CHD and ISWI enzymes to determine their precise nucleosome positioning functions using the reconstitution system followed by MNase-seq and single-molecule methylation footprinting (Fiber-seq). Third, I will reconstitute CRE recruitment through epigenetic modifications using our reconstitution system to investigate how epigenetic cues influence nucleosome positioning.
By combining an innovative chromatin reconstitution system with cutting-edge sequencing approaches and AI-driven discovery, vitroCHROM will deliver the first comprehensive picture of human CHD and ISWI remodeller function and recruitment. This compendium will uncover fundamental principles of the regulatory mechanisms that drive nucleosome positioning and establish the long-missing mechanistic framework needed to interpret how CRE malfunction causes human disease.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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HORIZON.1.1 - European Research Council (ERC)
HAUPTPROGRAMM
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
HORIZON-ERC - HORIZON ERC Grants
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Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
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(öffnet in neuem Fenster) ERC-2026-STG
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Finanzieller Nettobeitrag der EU. Der Geldbetrag, den der Beteiligte erhält, abzüglich des EU-Beitrags an mit ihm verbundene Dritte. Berücksichtigt die Aufteilung des EU-Finanzbeitrags zwischen den direkten Begünstigten des Projekts und anderen Arten von Beteiligten, wie z. B. Dritten.
37075 Goettingen
Deutschland
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.