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in silico bio-evolutio - novel AI paradigm for molecular biology

Projektbeschreibung

Eine KI-basierte Plattform zur Vorhersage der Wirksamkeit einer Phagentherapie

Eine erfolgreiche Phagentherapie setzt die korrekte Zuordnung einer Therapiephage zu einem Bakterienstamm voraus und erfordert zeitaufwendige manuelle In-vitro-Kalibrierungen. Das EU-finanzierte Projekt in silico bio-evolutio verfolgt das Ziel, bisherige Verfahren durch ein In-silico-Verfahren zu ersetzen, das den gesamten Vorgang beschleunigt und die Qualität der Phagentherapie verbessert. Grundlage der Lösung werden In-silico-Simulationen sein, die auf einer KI-basierten Plattform durchgeführt werden. Die Simulationen werden drei Funktionen erfüllen: die Vorhersage der Wirksamkeit einer ausgewählten Phage gegen spezifische Bakterienstämme; die Bestimmung von Mutationen, welche die Phagen-Wirksamkeit steigern können; und die Erstellung von Berichten, die die Vorhersageergebnisse erläutern.

Ziel

The success of phage therapies relies on correctly matching a therapeutic phage to bacterial strain. However calibration of therapy recipe may last for years. Presented solution enable to accelerate this by in silico simulations on AI platform for in vitro. It is able to find optimal phage that meets the phenotype imposed by the researcher, especially:
-predict given phage effectiveness against a specific bacteria strain,
-indicate mutations that increase phage effectiveness,
-generate explanations for predictions.

Currently, this process is performed by wet-lab employees (in vitro).
Replacing it with an in silico process will reduce the number 90 out of 100 experiments, significantly accelerating the process and improving phage therapy quality. At the same time, it’s the basis for modern probiotics (for microbiome modulation). At the same time, it will enable dynamically generate personalized therapies for specific patients. It is a novel endeavor in the area of molecular biology.

Koordinator

CAMINO SCIENCE SP. Z O.O.
Netto-EU-Beitrag
€ 1 692 596,00
Adresse
JUROWIECKA 21/9
15 101 BIALYSTOK
Polen

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KMU

Die Organisation definierte sich zum Zeitpunkt der Unterzeichnung der Finanzhilfevereinbarung selbst als KMU (Kleine und mittlere Unternehmen).

Ja
Region
Makroregion wschodni Podlaskie Białostocki
Aktivitätstyp
Private for-profit entities (excluding Higher or Secondary Education Establishments)
Links
Gesamtkosten
€ 2 417 995,00