Obiettivo
Networks of protein-protein interactions are central to cell and developmental biology and of great importance in molecular medicine. Given the potential importance of protein-protein interactions to healthcare, wealth creation and the biotech industry the re is an urgent need to train young researchers in the latest technologies aimed at identifying and dissecting such interactions by the very latest in high-throughput approaches, bio-informatics and rigorous biophysical analysis. We will train early-stage and experienced researchers to use new bio-informatics tools to direct high-throughput screening (HTS) for new protein-protein interactions. Network "hubs" or "nodes" (i.e. proteins/protein families that interact crucially with one or many other partners in the network) will be identified and used as baits in HTS.
Based on previous collaborative, published work, we will develop an in vitro selection system for protein-protein interactions by in vitro compartmentalisation (IVC). IVC relies on dispersing aqueous reactions into microscopic water-in-oil emulsion droplets ( ~5 fl) enabling selection of 10e10 pairs of interacting proteins. Hence, all ~10e9 possible pair wise binding interaction of proteins encoded by the human genome are possible in a more economical format than existing HTS techniques.
A novel system for covalently labelling proteins will be used to label and cross-link proteins in vivo and to create protein micro-arrays. Kinetic and thermodynamic characterisation of identified protein-protein interact ions will be performed using a variety of techniques including a novel acoustic biosensor. Most importantly, we aim at an integrated approach where the bio-informatics tools we develop will be used to direct the HTS efforts. In turn, results obtained from t he screening will help validate and tune our newly-developed computational tools, while detailed mechanistic studies will provide insight into the physiological role of newly-identified interacting pairs.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze naturali scienze biologiche biologia dello sviluppo
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine enzimi
È necessario effettuare l’accesso o registrarsi per utilizzare questa funzione
Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2004-MOBILITY-1
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
CAMBRIDGE
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.