Objetivo
Progress in bioengineering and biomedicine is limited by our inadequate understanding of genetic control systems in living cells. The lack of methods for studying kinetics and gene regulation in single cells seriously impairs our prospects to gain deeper insight to develop better quantitative models of such control systems. This project is focused on transcription factors (TFs), proteins that mediate gene regulation in all kingdoms of life. It aims at understanding how bacterial TFs coordinate the expression of genes at the level of single cells. The experimental challenge of studying TF mediated gene regulation directly is that it is a single molecule process where one or a few TF molecules bind one or a few binding sites on the bacterial chromosome. In addition studying TF kinetics poses two major theoretical challenges: its non-negligible spatial aspects and the stochastic nature of kinetics at the single molecule level. This proposal describes new state-of-the-art single molecule microscopy methods for studying kinetics and diffusion of TFs in living cells. The proposed experimental techniques will be accompanied by pioneering computational methods for stochastic reaction-diffusion modeling of intracellular kinetics. Only by the concomitant advancement of both methodologies will we gain understanding of how transcription factors operate in living cells, how their copy number is maintained, how different classes of TFs optimize their search for chromosomal targets, and how the location of TF genes and binding sites constrain genome evolution. Direct observation of TF dynamics will allow probing gene regulation with unprecedented time resolution. This makes it possible to test hypotheses about coordinated gene regulation which have so far been experimentally inaccessible. The unique combination of single molecule in vivo microscopy and spatially resolved stochastic modeling will advance Europe’s position at the frontier of systems biology.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica microscopía
- ciencias naturales informática y ciencias de la información ciencias de la computación
- ciencias naturales ciencias biológicas genética cromosoma
- ciencias naturales ciencias biológicas genética genoma
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
ERC-2007-StG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Institución de acogida
751 05 Uppsala
Suecia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.