Objectif
Progress in bioengineering and biomedicine is limited by our inadequate understanding of genetic control systems in living cells. The lack of methods for studying kinetics and gene regulation in single cells seriously impairs our prospects to gain deeper insight to develop better quantitative models of such control systems. This project is focused on transcription factors (TFs), proteins that mediate gene regulation in all kingdoms of life. It aims at understanding how bacterial TFs coordinate the expression of genes at the level of single cells. The experimental challenge of studying TF mediated gene regulation directly is that it is a single molecule process where one or a few TF molecules bind one or a few binding sites on the bacterial chromosome. In addition studying TF kinetics poses two major theoretical challenges: its non-negligible spatial aspects and the stochastic nature of kinetics at the single molecule level. This proposal describes new state-of-the-art single molecule microscopy methods for studying kinetics and diffusion of TFs in living cells. The proposed experimental techniques will be accompanied by pioneering computational methods for stochastic reaction-diffusion modeling of intracellular kinetics. Only by the concomitant advancement of both methodologies will we gain understanding of how transcription factors operate in living cells, how their copy number is maintained, how different classes of TFs optimize their search for chromosomal targets, and how the location of TF genes and binding sites constrain genome evolution. Direct observation of TF dynamics will allow probing gene regulation with unprecedented time resolution. This makes it possible to test hypotheses about coordinated gene regulation which have so far been experimentally inaccessible. The unique combination of single molecule in vivo microscopy and spatially resolved stochastic modeling will advance Europe’s position at the frontier of systems biology.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique chromosome
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2007-StG
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
751 05 Uppsala
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.