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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Systems Biology of the Heterobasidion-Spruce Interaction: Application of Metabolomics and Genomics to Understanding Host Resistance

Obiettivo

Root and butt rot of conifers caused by Heterobasidion is one of the most important tree diseases in the northern hemisphere. Despite the high impact of Heterobasidion, ability to control the disease in forests with a long history of management is very limited. Traits associated with resistance to pathogen growth appear to be highly heritable, and could be exploited in selection and breeding programmes. However, neither the molecular control nor the biochemical basis for this resistance is known in Picea species. This project will utilise state-of-the art metabolomics and genomics methods to elucidate biochemistry and gene regulation in Sitka spruce (Picea sitchensis) challenged with Heterobasidion annosum, in relation to lesion development and extension growth of the pathogen in bark tissues. Responses of six mature Sitka spruce clones differing in susceptibility/resistance will be assessed after wounding and artificial inoculation with three isolates of H. annosum differing in virulence at 0, 3, 7, 21 and 35 days after treatment. Bark tissues surrounding the wounding and inoculation points will be analyzed for phenolic and terpenoid components using LC-MS-based metabolomic techniques to identify changes in the metabolome of spruce bark and pinpoint key constitutive and induced differences between resistant and susceptible host genotypes. Key genes in metabolic pathways identified as upregulated in metabolomics will be examined in detail using gene expression analyses based on quantitative PCR. This project will increase our knowledge of the physiological processes involved in resistance of spruce to infection by Heterobasidion, enabling accurate and rapid identification of host genotypes showing greater resistance to the pathogen. Such resistant clones will be of very high value in breeding programmes, in forests having high incidence of Heterobasidion and in the extensive afforestations now planned on agricultural land taken out of food production.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2007-2-1-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

THE UNIVERSITY COURT OF THE UNIVERSITY OF ABERDEEN
Contributo UE
€ 169 957,94
Indirizzo
KING'S COLLEGE REGENT WALK
AB24 3FX Aberdeen
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
Scotland North Eastern Scotland Aberdeen City and Aberdeenshire
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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