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Contenuto archiviato il 2024-05-30

Genomics and effectoromics to understand defence suppression and disease resistance in Arabidopsis-Albugo candida interactions

Obiettivo

This project focuses on two questions about host/parasite interactions: how do biotrophic plant pathogens suppress host defence? and, what is the basis for pathogen specialization on specific host species? A broadly accepted model explains resistance and susceptibility to plant pathogens. First, pathogens make conserved molecules ( PAMPS ) such as flagellin, that plants detect via cell surface receptors, leading to PAMP-Triggered Immunity (PTI). Second, pathogens make effectors that suppress PTI. Third, plants carry 100s of Resistance (R) genes that detect an effector, and activate Effector-Triggered Immunity (ETI). One effector is sufficient to trigger resistance. Albugo candida (Ac) (white rust) strongly suppresses host defence; Ac-infected Arabidopsis are susceptible to pathogen races to which they are otherwise resistant. Ac is an oomycete, not a fungus. Arabidopsis is resistant to races of Ac that infect brassicas. The proposed project involves three programs. First ( genomics, transcriptomics and bioinformatics ), we will use next-generation sequencing (NGS) methods (Solexa and GS-Flex), and novel transcriptomics methods to define the genome sequence and effector set of three Ac strains, as well as carrying out >40- deep resequencing of 7 additional Ac strains. Second, ( effectoromics ), we will carry out functional assays using Effector Detector Vectors (Sohn Plant Cell 19:4077 [2007]), with the set of Ac effectors, screening for enhanced virulence, for suppression of defence, for effectors that are recognized by R genes in disease resistant Arabidopsis and for host effector targets. Third, ( resistance diversity ), we will characterize Arabidopsis germplasm for R genes to Ac, both for recognition of Arabidopsis strains of Ac, and for recognition in Arabidopsis of effectors from Ac strains that infect brassica. This proposal focuses on Ac, but will establish methods that could discover new R genes in non-hosts against many plant diseases.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2008-AdG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-AG - ERC Advanced Grant

Istituzione ospitante

THE SAINSBURY LABORATORY
Contributo UE
€ 2 498 923,00
Indirizzo
Norwich Research Park, Colney Lane
NR47UH Norwich
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
East of England East Anglia Breckland and South Norfolk
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

Beneficiari (1)

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