Objectif
14-3-3 proteins, found in all eukaryotic cells, are known to be important in cell-cycle regulation, apoptosis, and regulation of gene expression. They are also associated with oncogenic and neurodegenerative amyloid diseases. 14-3-3 proteins are active as homo- or heterodimers and bind more than 300 diverse target phosphoproteins, thereby forcing conformational changes or/and stabilizing active conformations in their target proteins. To date, no crystal structure is known for a 14-3-3 dimer in complex with a doubly phosphorylated target protein; this prevents a full understanding of the 14-3-3 molecular mechanism. I propose a computational approach to model the function of 14-3-3s on three of its target ligands: serotonin N-acetyltransferase (AANAT), tyrosine hydroxylase, and tryptophan hydroxylase. This approach will combine restrained molecular dynamics simulation for phosphorylated residues with the novel Hamiltonian replica exchange using soft-core interactions developed by myself and Dr. Oostenbrink. The obtained structure for 14-3-3/AANAT will be compared with the available crystal structure of AANAT in its active form. Computationally predicted structures of doubly phosphorylated tyrosine hydroxylase or doubly phophorylated tryptophan hydroxylase in complex with a 14-3-3 dimer will be verified by comparison with several fingerprint-type NMR spectra measured for each complex during the proposed project. The proposed approach will have general applicability to most doubly phosphorylated 14-3-3 protein ligands. The research proposed here will not only deepen our understanding of 14-3-3 function, but will also enhance our knowledge of essential basic mechanisms with respect to key regulatory proteins.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux cristaux
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IOF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
601 77 Brno
Tchéquie
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.