Objetivo
Signal transduction enables biological cells to respond to external stimuli such as light, odours, hormones, or growth factors. Signalling is involved in numerous biological processes and dysfunction of signalling has been associated to severe conditions such as cancer or Alzheimer’s disease. Whereas the knowledge of signal transduction on the cellular level has seen impressive progress within the last years, the molecular mechanisms involved in signalling remain mostly unknown. Intra-protein signalling is accomplished by subtle configurational changes and/or rapid dynamic processes which are difficult to assess experimentally. Therefore, we aim to employ molecular dynamics (MD) simulations to elucidate intra-protein signalling pathways and molecular mechanisms involved in signalling. Two important classes of signalling proteins will be studied: G-protein coupled receptors (GPCRs) and PDZ protein binding domains. The key to elucidate the signalling pathways will be to identify the correlations in protein dynamics and ensembles which transmit the biological signal. We plan to employ procedures from information theory and multivariate analysis to directly assess the propagation of the signal in the protein motions. The approach promises to clearly separate intra-protein processes involved in signalling from motions and interactions which may be important (e.g. for protein stability), but which do not contribute to the signal. Moreover, the simulations will allow us to distinguish between the “induced-fit” and the “conformational selection” model for signal transduction. By applying these methods to GPCRs and different PDZ domains we aim to determine common routes of information transfer within these important classes of proteins. Understanding how information is transferred within living organisms is a prerequisite for interfering with signalling, and hence our approach may contribute to novel therapies in the future.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias médicas y de la salud medicina básica neurología demencia alzheimer
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias médicas y de la salud medicina clínica oncología
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
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Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
751 05 Uppsala
Suecia
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.