Objectif
Signal transduction enables biological cells to respond to external stimuli such as light, odours, hormones, or growth factors. Signalling is involved in numerous biological processes and dysfunction of signalling has been associated to severe conditions such as cancer or Alzheimer’s disease. Whereas the knowledge of signal transduction on the cellular level has seen impressive progress within the last years, the molecular mechanisms involved in signalling remain mostly unknown. Intra-protein signalling is accomplished by subtle configurational changes and/or rapid dynamic processes which are difficult to assess experimentally. Therefore, we aim to employ molecular dynamics (MD) simulations to elucidate intra-protein signalling pathways and molecular mechanisms involved in signalling. Two important classes of signalling proteins will be studied: G-protein coupled receptors (GPCRs) and PDZ protein binding domains. The key to elucidate the signalling pathways will be to identify the correlations in protein dynamics and ensembles which transmit the biological signal. We plan to employ procedures from information theory and multivariate analysis to directly assess the propagation of the signal in the protein motions. The approach promises to clearly separate intra-protein processes involved in signalling from motions and interactions which may be important (e.g. for protein stability), but which do not contribute to the signal. Moreover, the simulations will allow us to distinguish between the “induced-fit” and the “conformational selection” model for signal transduction. By applying these methods to GPCRs and different PDZ domains we aim to determine common routes of information transfer within these important classes of proteins. Understanding how information is transferred within living organisms is a prerequisite for interfering with signalling, and hence our approach may contribute to novel therapies in the future.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale neurologie démence alzheimer
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences médicales et de la santé médecine clinique oncologie
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
751 05 Uppsala
Suède
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.