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CORDIS - Resultados de investigaciones de la UE
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Contenido archivado el 2024-06-18

Integrated protein evolution model

Objetivo

Proteins evolve to highly diverged sequence, function and structure. The dynamics of protein evolution is fundamental for understanding how natural protein evolve, and also for creating new proteins in the laboratory for medical and industrial use. “Epistasis”, which is the interaction between the effects of mutations, is often observed in nature and is the central to understand the dynamics of evolution, because it shapes the passages in the evolution. However, epistasis has been considered to be a quite complicated phenomenon and difficult to predict, thus it seemed that the dynamics of protein evolution was difficult to understand. In this project, I propose a new integrated protein evolution model which describes the fitness of protein from the physico-chemical properties of proteins. In this model, the structure of the fitness cause of epistasis of the fitness even though there is no interaction between the effects of mutations in physico-chemical properties; The fitness of protein (enzymatic activity in the cell: v0) is multiplication of function (enzymatic activity: kcat/KM) and fraction of functional expression level of protein (enzyme concentration: [E]). And the fraction of functional expression level is non-linearly correlated to the stability of proteins (∆∆G) due to unfolding, aggregation, degradation of proteins. This model will provide a new insight of epistasis and enable us to predict and understand the dynamics of protein evolution. I will validate and refine the model comparing the experimental evolution experiments. Furthermore, I will apply this model to analyze mono-genetic disease related proteins to establish the way to diagnose potential patients. This integrated protein evolution model will revolutionize the way how we study the dynamics of protein evolution, innovate the methodology of directed evolution, and make significant impact on the study of the network and biological evolution.

Ámbito científico (EuroSciVoc)

CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..

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Palabras clave

Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).

Programa(s)

Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.

Tema(s)

Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.

Convocatoria de propuestas

Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.

FP7-PEOPLE-IEF-2008
Consulte otros proyectos de esta convocatoria

Régimen de financiación

Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinador

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Aportación de la UE
€ 173 568,66
Dirección
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Reino Unido

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Región
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Tipo de actividad
Higher or Secondary Education Establishments
Enlaces
Coste total

Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.

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