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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Integrated protein evolution model

Objectif

Proteins evolve to highly diverged sequence, function and structure. The dynamics of protein evolution is fundamental for understanding how natural protein evolve, and also for creating new proteins in the laboratory for medical and industrial use. “Epistasis”, which is the interaction between the effects of mutations, is often observed in nature and is the central to understand the dynamics of evolution, because it shapes the passages in the evolution. However, epistasis has been considered to be a quite complicated phenomenon and difficult to predict, thus it seemed that the dynamics of protein evolution was difficult to understand. In this project, I propose a new integrated protein evolution model which describes the fitness of protein from the physico-chemical properties of proteins. In this model, the structure of the fitness cause of epistasis of the fitness even though there is no interaction between the effects of mutations in physico-chemical properties; The fitness of protein (enzymatic activity in the cell: v0) is multiplication of function (enzymatic activity: kcat/KM) and fraction of functional expression level of protein (enzyme concentration: [E]). And the fraction of functional expression level is non-linearly correlated to the stability of proteins (∆∆G) due to unfolding, aggregation, degradation of proteins. This model will provide a new insight of epistasis and enable us to predict and understand the dynamics of protein evolution. I will validate and refine the model comparing the experimental evolution experiments. Furthermore, I will apply this model to analyze mono-genetic disease related proteins to establish the way to diagnose potential patients. This integrated protein evolution model will revolutionize the way how we study the dynamics of protein evolution, innovate the methodology of directed evolution, and make significant impact on the study of the network and biological evolution.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Mots‑clés

Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-IEF-2008
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

THE CHANCELLOR MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF CAMBRIDGE
Contribution de l’UE
€ 173 568,66
Adresse
TRINITY LANE THE OLD SCHOOLS
CB2 1TN CAMBRIDGE
Royaume-Uni

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Région
East of England East Anglia Cambridgeshire CC
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
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