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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Exploring the dark matter of the human brain transcriptome: The origin and function of long non-coding RNAs

Obiettivo

Genome-wide transcription maps of different model species [1-5] reveal an unforeseen number of transcribed DNA segments lacking protein-coding potential [1, 2, 4, 5]. These non-protein-coding RNAs (ncRNAs) are frequently expressed in the brain [6] and, although generally acknowledged as functionally relevant, the biological role of most long ncRNAs remains unclear mainly due to the lack of prediction tools and testable hypotheses. Recent work in the host institution indicates that some brain-expressed ncRNAs regulate the transcription of adjacent protein-coding genes thus providing a criterion to target long ncRNA for further characterization (Ponjavic, J. et al submitted). We propose to compile and analyze a catalog of human long ncRNAs and use it to understand when and how these transcripts emerged during evolution. Using a combination of in silico and in vitro experiments we will identify and functionally characterize long ncRNAs in the human genome, and test the recent hypothesis that some of these transcripts are involved in the transcriptional regulation of their adjacent protein-coding genes. We will particularly focus on transcripts that are specific to primates, as these are more likely to contribute to recently emerged features of the human brain including their relative increase in brain size and complexity. The proposed identification and functional characterization of young brain-expressed ncRNAs is timely and combines the applicant’s expertises in protein-coding gene evolution and the computational and ncRNA competences available in the host institution.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-IEF-2008
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

THE CHANCELLOR, MASTERS AND SCHOLARS OF THE UNIVERSITY OF OXFORD
Contributo UE
€ 181 350,76
Indirizzo
WELLINGTON SQUARE UNIVERSITY OFFICES
OX1 2JD Oxford
Regno Unito

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Regione
South East (England) Berkshire, Buckinghamshire and Oxfordshire Oxfordshire
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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