Objectif
Understanding how biochemical signaling networks encode biological specificity is a fundamental challenge for biologists in the 21st century. Genome sequences by providing the “parts list” for such signaling networks, were expected to advance insight. However, it has become clear that to understand specificity analyzing only the “parts list” is not enough; it is the complex orchestration of these parts’s expression, interactions, activation, and deactivation in both space and time that encode biological specificity. Thus, understanding the biological specificity code requires investigating the spatiotemporal dynamics of biochemical signaling networks. This proposal focuses on understanding how the spatiotemporal dynamics of epidermal growth factor (EGF) gradient-induced signaling and associated feedback loops encode a cell’s decision to migrate and invade. A particular focus is on the isoform-specific roles of ERK1, ERK2, Akt1, and Akt2. Traditionally, these protein isoforms have been assumed to have very similar roles in the phenotypic response to EGF signaling. However, our preliminary data show that these isoforms have very distinct, opposing roles for control of EGF gradient-induced cell migration in an aggressively migrating mammalian cell line. To measure, interpret, and understand EGF gradient-induced signaling and the resultant cell migration, we propose using an interdisciplinary, systems biology approach combining modern biochemistry, quantitative mass spectrometry, live-cell imaging, spatially-resolved mechanistic modeling, and empirical data-driven modeling. Model-based experimental design will be the hub that connects modeling with experiments through an iterative model building cycle. As result we hope to gain a mechanistic understanding of how EGF gradient signals are spatially propagated through a cell, coupled with the ability to predict cell migration outcomes based on the spatiotemporal signaling patterns.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie
- sciences naturelles sciences biologiques biologie cellulaire signalisation cellulaire
- sciences naturelles sciences chimiques chimie analytique spectrométrie de masse
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IIF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
4 DUBLIN
Irlande
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.