Objetivo
The circadian clock is an endogenous oscillator that drives daily rhythms in physiology and behavior. The mechanism underlying circadian timekeeping is cell-autonomous and oscillations are generated by interconnecting transcriptional and translational feedback loops. To date large-scale approaches to study molecular circadian rhythms have been limited to the analysis of the transcriptome (mRNA). However, the “true” mediators of cellular functions are proteins. Recent advances in mass spectrometric and bioinformatics technology now allow global quantitation of protein abundance and phosphorylation. The aim of this proposal is to apply the latest methodology in mass spectrometry and bioinformatics, in combination with stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC), or in mice, to the investigation of circadian clocks in mammals. I propose to perform a comprehensive quantitative analysis of protein and phosphoprotein circadian oscillations in mouse tissues. The results will be compiled in a database, linked to the European Bioinformatics Institute and available to the scientific community, containing the circadian profiles of all the identified proteins and phosphoproteins in different organs. In addition, I intend to use SILAC-based quantitative proteomics, to identify novel regulators of the circadian transcriptional activity by isolating and analyzing protein complexes bound to clock DNA consensus sequences, and to investigate the molecular interplay between the circadian clock and the DNA-repair machinery. In summary, the objectives of this proposal aim to pioneer the application of SILAC- and mass spectrometry-based proteomics in the quantification of circadian oscillations of proteins and phosphoproteins as well as in the identification of clock components and their interplay with proteins of the genotoxic response.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: https://op.europa.eu/es/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas proteómica
- ciencias médicas y de la salud medicina básica fisiología
- ciencias naturales ciencias biológicas zoología mamalogía
- ciencias naturales ciencias químicas química orgánica aminas
- ciencias naturales ciencias químicas química analítica espectrometría de masas
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
80539 MUNCHEN
Alemania
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.