Obiettivo
The circadian clock is an endogenous oscillator that drives daily rhythms in physiology and behavior. The mechanism underlying circadian timekeeping is cell-autonomous and oscillations are generated by interconnecting transcriptional and translational feedback loops. To date large-scale approaches to study molecular circadian rhythms have been limited to the analysis of the transcriptome (mRNA). However, the “true” mediators of cellular functions are proteins. Recent advances in mass spectrometric and bioinformatics technology now allow global quantitation of protein abundance and phosphorylation. The aim of this proposal is to apply the latest methodology in mass spectrometry and bioinformatics, in combination with stable isotope labeling by amino acids in cell culture (SILAC), or in mice, to the investigation of circadian clocks in mammals. I propose to perform a comprehensive quantitative analysis of protein and phosphoprotein circadian oscillations in mouse tissues. The results will be compiled in a database, linked to the European Bioinformatics Institute and available to the scientific community, containing the circadian profiles of all the identified proteins and phosphoproteins in different organs. In addition, I intend to use SILAC-based quantitative proteomics, to identify novel regulators of the circadian transcriptional activity by isolating and analyzing protein complexes bound to clock DNA consensus sequences, and to investigate the molecular interplay between the circadian clock and the DNA-repair machinery. In summary, the objectives of this proposal aim to pioneer the application of SILAC- and mass spectrometry-based proteomics in the quantification of circadian oscillations of proteins and phosphoproteins as well as in the identification of clock components and their interplay with proteins of the genotoxic response.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine proteomica
- scienze mediche e della salute medicina di base fisiologia
- scienze naturali scienze biologiche zoologia mammologia
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica ammine
- scienze naturali scienze chimiche chimica analitica spettrometria di massa
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
80539 Munchen
Germania
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.