Objectif
A mechanistic understanding of a living cell requires the characterization of the architecture and dynamic assembly of its macromolecular complexes. The proposed project describes a novel integrative approach to determine the topology of protein networks and higher order assemblies using chemical crosslinking, state of the art mass spectrometry (MS) and cryo-electron tomography (cryo-ET). This MS based strategy will enable the high-throughput detection and integration of structural data of biological systems. As a promising target we have chosen a giant key cell division structure, the human kinetochore, which is crucial for faithful chromosome segregation during cell division. Up to now, a comprehensive understanding of its cell cycle-regulated assembly and the nature of interactions between its protein components remain elusive. To investigate the architecture of the kinetochore we propose to apply a novel MS based crosslinking strategy that allows monitoring of protein interfaces at primary structure level. We plan to combine this technology with cryo-ET of the native kinetochore structure and of affinity-purified kinetochore complexes. Based on the spatial restraints obtained by MS, subunits can be fitted into electron density maps with high confidence, which will facilitate the generation of a 3D topological map of the entire kinetochore. Currently, there is no mechanistic understanding of the temporal dynamics of kinetochore protein assembly/disassembly which presumably involves cell cycle-controlled synthesis and degradation, as well as post-translational cues. To measure alterations in protein levels and phosphorylation status, we will investigate purified subcomplexes or whole cell lysates by quantitative targeted MS methods pioneered by the host institution. The resulting abundance information of proteins and their phosphorylation sites promises to reveal the stoichiometric relationships of kinetochore components and their cell cycle-regulated assembly.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-IEF-2008
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
8092 Zuerich
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.