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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Viral metagenomics of human pathologies with unknown etiology

Obiettivo

While viral infections create an important threat for humanity, our knowledge of the viruses that infect humans is largely incomplete. So far, discovery of new viruses has been limited by the inability to propagate them in cell culture, the lack of serological cross-reactivity, or the absence of conserved genetic element to target by PCR. Thus, numerous acute and chronic diseases with unknown etiology are caused by yet unidentified viruses. Among the highest failure rates in determining the etiological cause of disease, pneumonia, encephalitis, and pericarditis are usually cited. In these cases, the search for unknown viruses is an urgent scientific task. We propose to identify new viruses, both indigenous and pathogenic, using metagenomics (shotgun Sanger sequencing and 454 pyrosequencing) of RNA and DNA from purified viral particles found in clinical samples of individuals presenting encephalitis, pneumonia, or pericarditis diseases without known etiology. Virus-centered bioinformatics methods will be developed to detect close as well as distant relatives of known viral species. Initial viral sequence similarity analysis will be followed by full viral genome reconstruction and phylogenetic analysis. The prevalence, abundance, and geographical distribution of newly identified viruses will then be determined using quantitative real-time PCR and RT-PCR on a 10-year collection of samples from extensively characterized patients.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2009-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

CENTRE NATIONAL DE LA RECHERCHE SCIENTIFIQUE CNRS
Contributo UE
€ 831 902,00
Indirizzo
RUE MICHEL ANGE 3
75794 PARIS
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Paris
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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