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Contenuto archiviato il 2024-05-27

Uncultivated Microbes In Situ - a Computational Biology Approach to Determine Molecular Capabilities and Ecological Roles

Obiettivo

Most of nature s biodiversity, and many potentially useful metabolic capabilities, remain hidden among the vast numbers of uncharacterized environmental microbes. Because cultivation is still not possible for most of these microbes, cultivation-independent molecular techniques such as polymerase chain reaction (PCR), fluorescent in situ hybridization (FISH), or shotgun DNA sequencing have been used in order to study their function and ecology in their natural habitats. However, none of the above techniques have so far been sufficient for any systematic assignment of molecular functions to distinct microbial lineages. Thus, most of the molecular ecology of natural microbes remains elusive. Here, we propose a computational meta-analysis and synthesis of existing and newly generated molecular sequence data sampled directly from the environment combining DNA sequencing data (metagenomics), and proteome expression data (metaproteomics). This analysis will be coupled to computational modelling of genome content evolution at the community level. We will aim to assess how gene repertoires of microbial communities, and their taxonomic compositions, change across distinct environments, in response to changed conditions, and through time. We plan to address fundamental questions in microbial ecology, including the extent of cooperation among members of the communities, stability of community composition at evolutionary timescales, the importance of lateral gene transfers, the extent of functional adaptation/regulation in situ, and whether gene occurrence and expression patterns are diagnostic of community functions and ecological status.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Parole chiave

Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).

Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2009-StG
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

University of Zurich
Contributo UE
€ 1 129 800,00
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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