Objetivo
Phenotype is a manifestation of a complicated relationship between the gene sequence that dictates the “what” of gene expression and regulatory elements that supply the crucial “when, where, and how.” The central components of gene regulation are transcription factors (TFs) – proteins that regulate transcription by binding to DNA regions adjacent to the gene. While TFs recognize specific DNA sequences, we do not fully understand the rules that allow regulators to distinguish among the millions of potentially bind-able sequences in the genome to select the tens of thousands chosen to be bound in vivo. Uncovering these rules is a key step in understanding the developmental and evolutionary processes that shape the observed phenotypic variation. Based on previous experiments we know that, despite the assumption that conserved function will correlate with conservation of TF binding, most TF binding events are species-specific (i.e. not evolutionarily conserved) and are driven by the underlying genetic sequence, not inter-species differences in nuclear environment. In this project, I will experimentally dissect the long-range sequence patterns that govern transcription factor binding. Aim 1: Scan TF binding in closely related species. I will use liver hepatocytes from closely related mouse strains to map the TF binding sites using chromatin immunoprecipitation (ChIP) combined with ultra highthroughput DNA sequencing (ChIP-seq). Aim 2: Identify species-specific TF binding events that do not follow simple binding rules. Find the long-range sequence changes associated with these events. Aim 3: Confirm our findings in related species and formulate rules underlying TF binding. A Marie-Curie International Reintegration Grant would enable this cutting-edge research and help me apply the molecular biology and population genetics skills I obtained during my PhD and postdoc in the United States in an excellent laboratory in the European Union.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas genética ADN
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas biología evolutiva
- ciencias naturales ciencias biológicas genética nucleótido
- ciencias naturales ciencias biológicas biología molecular
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Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP7-PEOPLE-2009-RG
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
E20 1JQ LONDON
Reino Unido
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.