Los elementos evolutivos que afectan a la expresión génica
El código genético es el responsable de los genes que heredamos, pero los elementos reguladores controlan el momento y el lugar de la expresión génica. Un elemento crucial de la regulación génica son los factores de transcripción (FT). Se trata de proteínas que se unen a los genes o a otras moléculas y facilitan el proceso de transcripción. Aunque cada FT reconoce una secuencia de ADN específica, aún se desconoce por qué se unen únicamente a una fracción de estos puntos de unión en un determinado momento. Conocer los factores implicados en estos mecanismos de elección podría facilitar la comprensión de la divergencia evolutiva. Para ello, el equipo del proyecto «Globally connecting single nucleotide variations to transcriptional regulation in vivo» (SNPS AND TF BINDING), financiado con fondos europeos, investigó cómo se relacionaba la secuencia genética de fragmentos no codificantes del genoma con diferencias fenotípicas en especies cercanas evolutivamente. Se identificaron cincuenta mil puntos de unión en el genoma de células hepáticas de cepas de ratón para tres FT determinados (CEBPa, HNF4a y FoxA1). La secuenciación de estos puntos determinó no solo la localización de la unión para cada FT, también la intensidad de esta unión. Para los tres FT se observaron modificaciones tanto en la localización física como en la intensidad de la unión. Aunque, en parte, es posible que esto se deba a cambios en la secuencia génica, se trataba de un fuerte indicador de divergencia evolutiva en la unión de los FT. Con objeto de analizar experimentalmente si los cambios en la unión de los FT afectan a todo el grupo de FT para un gen determinado, se utilizaron modelos de ratón transgénico que carecían de un FT implicado en el desarrollo y la actividad del hígado (CEBPa). No se observaron grandes modificaciones en la unión de los otros FT, probablemente debido a la compensación por FT similares. En conjunto, los datos obtenidos durante el estudio SNPS AND TF BINDING apoyan la teoría según la cual a pesar de que la actividad y la expresión génica se conservan a lo largo de la evolución, la mayoría de los procesos de unión de los FT son específicos de cada especie. Esta información permite aumentar el conocimiento sobre el origen de la diversidad fenotípica y los principales elementos involucrados.
