Objectif
This project seeks to find specific peptide dendrimers through combinatorial chemistry, to be used as highly specific, fluorogenic protease substrates. A general approach is formulated that should allow to discover fluorescent dendrimer probes specific of any given protease. To that extent, combinatorial synthesis of dendrimers incorporating target sequences for well-known proteases will be carried out.
Then, a suitable FRET (fluorescence resonance energy transfer) strategy for protease activity detection will be developed and optimized using dendrimers with selective cleavage sequences for model proteases. Red fluorescence will be preferable to blue fluorescence, especially when considering a potential in vivo diagnostic application.
Then, fluorogenic peptide dendrimers incorporating target sequences for proteases of diagnostic interest (cathepsins, uPA, PSA) will be synthesized and tested. Finally the optimized assay will be adapted as a microarray by covalently binding the dendrimers on a glass surface. This project takes advantage of the optimized split and mix, biased dendrimer synthesis techniques developed in the host group.
Using these technique, the combinatorial library encoding/decoding is particularly efficient. The application of combinatorial chemistry to the problem of protease substrate selectivity is novel. In fact some sequences arising from libraries have been reported to be better substrates than the 'natural' target sequence.
To the present date, specific target probes on linear peptides have been used, either on a standalone basis or grafted onto a linear structure, but not with the dendrimer being carrier and substrate itself, or using its own three-dimensional structure as a feature to modulate the interaction with different proteases and therefore, to achieve selectivity in the cleavage of target aminoacid sequences.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule
- ingénierie et technologie ingénierie des materiaux solides amorphes
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Mots‑clés
Les mots-clés du projet tels qu’indiqués par le coordinateur du projet. À ne pas confondre avec la taxonomie EuroSciVoc (champ scientifique).
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP6-2002-MOBILITY-5
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.