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CORDIS - Forschungsergebnisse der EU
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Inhalt archiviert am 2024-05-29

Probes for protease activity based on fluorescent peptide dendrimers

Ziel

This project seeks to find specific peptide dendrimers through combinatorial chemistry, to be used as highly specific, fluorogenic protease substrates. A general approach is formulated that should allow to discover fluorescent dendrimer probes specific of any given protease. To that extent, combinatorial synthesis of dendrimers incorporating target sequences for well-known proteases will be carried out.

Then, a suitable FRET (fluorescence resonance energy transfer) strategy for protease activity detection will be developed and optimized using dendrimers with selective cleavage sequences for model proteases. Red fluorescence will be preferable to blue fluorescence, especially when considering a potential in vivo diagnostic application.

Then, fluorogenic peptide dendrimers incorporating target sequences for proteases of diagnostic interest (cathepsins, uPA, PSA) will be synthesized and tested. Finally the optimized assay will be adapted as a microarray by covalently binding the dendrimers on a glass surface. This project takes advantage of the optimized split and mix, biased dendrimer synthesis techniques developed in the host group.

Using these technique, the combinatorial library encoding/decoding is particularly efficient. The application of combinatorial chemistry to the problem of protease substrate selectivity is novel. In fact some sequences arising from libraries have been reported to be better substrates than the 'natural' target sequence.

To the present date, specific target probes on linear peptides have been used, either on a standalone basis or grafted onto a linear structure, but not with the dendrimer being carrier and substrate itself, or using its own three-dimensional structure as a feature to modulate the interaction with different proteases and therefore, to achieve selectivity in the cleavage of target aminoacid sequences.

Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)

CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.

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Schlüsselbegriffe

Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).

Thema/Themen

Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.

Aufforderung zur Vorschlagseinreichung

Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.

FP6-2002-MOBILITY-5
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Finanzierungsplan

Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.

EIF - Marie Curie actions-Intra-European Fellowships

Koordinator

UNIVERSITäT BERN
EU-Beitrag
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Adresse


Schweiz

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Gesamtkosten

Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.

Keine Daten
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