Objectif
Electron microscopy (EM) is an invaluable tool for investigating the nanometer-scale organization of molecular assemblies such as viruses, but is restricted to dead cells, does not readily label targeted proteins, and is prone to fixation artefacts. Recently developed methods to break the diffraction limit in optical microscopy have the potential to resolve protein arrangements in living cells. However, their resolution is currently restricted to ~20-30 nm, still an order of magnitude removed from EM, and dynamic super-resolution imaging remains challenging. Here, we aim to reconstruct the protein arrangements of molecular structures at resolutions better than 20 nm by harnessing the power of statistics, i.e. by aggregating images from hundreds or thousands of copies of nearly-identical structures and when possible by exploiting their symmetry. To do this, we will adapt computational methods of single particle reconstruction from electron microscopy to super-resolution optical microscopy. After validation on synthetic data, we will test and apply these methods to nuclear pores and adenovirus capsids. These examples have been chosen because of their geometric features that work well with our approaches. Particularly, we are interested in obtaining novel insight into the dynamic structural changes occurring at the nuclear pore complex during active transport. Furthermore, we aim to decipher the sequence of events during viral capsid formation. This work has the potential to further push the resolution of optical microscopy towards that of electron microscopy for the analysis of ordered molecular assemblies. If successful, our project will open the door to structural investigations in living cells, including the assembly process of viral particles, or the plasticity of the nuclear pores and its role in nucleo-cytoplasmic transport.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie virologie
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie microscopie à super-résolution
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences physiques optique microscopie electron microscopy
- sciences naturelles informatique et science de l'information science informatique
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
75724 Paris
France
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.