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CORDIS - Risultati della ricerca dell’UE
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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Computing the structure and dynamics of protein assemblies in living cells by coupling sub-diffraction fluorescence microscopy with single-particle reconstruction: application to viral capsids

Obiettivo

Electron microscopy (EM) is an invaluable tool for investigating the nanometer-scale organization of molecular assemblies such as viruses, but is restricted to dead cells, does not readily label targeted proteins, and is prone to fixation artefacts. Recently developed methods to break the diffraction limit in optical microscopy have the potential to resolve protein arrangements in living cells. However, their resolution is currently restricted to ~20-30 nm, still an order of magnitude removed from EM, and dynamic super-resolution imaging remains challenging. Here, we aim to reconstruct the protein arrangements of molecular structures at resolutions better than 20 nm by harnessing the power of statistics, i.e. by aggregating images from hundreds or thousands of copies of nearly-identical structures and when possible by exploiting their symmetry. To do this, we will adapt computational methods of single particle reconstruction from electron microscopy to super-resolution optical microscopy. After validation on synthetic data, we will test and apply these methods to nuclear pores and adenovirus capsids. These examples have been chosen because of their geometric features that work well with our approaches. Particularly, we are interested in obtaining novel insight into the dynamic structural changes occurring at the nuclear pore complex during active transport. Furthermore, we aim to decipher the sequence of events during viral capsid formation. This work has the potential to further push the resolution of optical microscopy towards that of electron microscopy for the analysis of ordered molecular assemblies. If successful, our project will open the door to structural investigations in living cells, including the assembly process of viral particles, or the plasticity of the nuclear pores and its role in nucleo-cytoplasmic transport.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2009-IEF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinatore

INSTITUT PASTEUR
Contributo UE
€ 165 645,60
Indirizzo
RUE DU DOCTEUR ROUX 25-28
75724 Paris
Francia

Mostra sulla mappa

Regione
Ile-de-France Ile-de-France Hauts-de-Seine
Tipo di attività
Research Organisations
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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