Objectif
The aim of this research proposal is to investigate in detail the location and mobility of RNA degradation machinery in E. coli. RNA decay has been widely studied in bacteria but continues to reveal subtle secrets [1,2]. Recent research demonstrates that the degradosome complex forms cytoskeletal-like structures linked with the inner cell membrane [3]. Preliminary results from Cecilia Arraiano’s laboratory (host laboratory) have shown that RNase R colocalises with the bacterial nucleoid, whereas RNase II is exclusively a cytoplasmic protein. Consequently, the main bacterial nucleases may have different cellular locations. After developing a system for in vivo localisation of RNases I will investigate their dynamics, likely factors that influence their mobility, and consequences of differential location. Because environmental stresses alter levels of RNases, I will check whether rearrangement of the degradation machinery is connected to changes in its cell location, and/or is linked to the formation of degradation foci analogous to eukaryotic processing/degradation P-bodies. This year it was reported in Science that abortive E. coli polymerase transcripts are produced in vivo during transcription initiation [4]. I will therefore investigate whether RNase R location in the nucleoid is functionally connected to degradation of these newly discovered small RNAs.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques microbiologie bactériologie
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ARN
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
2784-505 OEIRAS
Portugal
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.