Objectif
Planktonic eukaryotes are keystone players in the global carbon cycle, yet knowledge about their population diversity is late. This is not surprising since we are still actively investigating species richness, within these very diverse organisms. Phytoplankter are difficult to isolate and grow in the lab, so that direct analysis of their DNA sequence is the unique way to gain knowledge into their diversity and lifestyle. PICOPOP is about developing a population genomics approach, the analysis of the genetic variation between individuals from the same species at the genome level, to unravel intraspecific diversity in one model picophytoplanktonic species, Ostreococcus tauri, (OT). This approach has been successfully applied to species ranging from bakers’ yeast to humans, plants and insects. Knowledge about these population parameters is essential to gain insights into the species adaptive potential in response to environmental variation as climate change. OT provides an ideal model for the enclosed timely and feasible research proposal on intraspecific eukaryotic phytoplankton diversity because it is ubiquitous and the availability of a complete reference genome sequence. The JGI has recently accepted our project to sequence 20 complete genomes of OT strains isolated in the Mediterranean sea, using 454 technology. From an analytical point of view, research is late in the treatment of this new kind of data. PICOPOP thus assembles appropriate expertise of complementary partners (biologists, bioinformaticians and population geneticists) to adapt and develop the tools required throughout the analysis from raw 454 reads interpretation to analysis. Unicellular eukaryotic organisms represent much of the ocean’s reserve of biodiversity, and we expect that the results and methods developed in PICOPOP on a picophytoplanktonic model organism will both provide state of the art sequence analysis tools and shed light on the lifestyle and diversity of other planktonic species.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences naturelles sciences biologiques écologie écosystème
- sciences naturelles sciences biologiques zoologie entomologie
- sciences naturelles sciences de la Terre et sciences connexes de l'environnement sciences de l'atmosphère climatologie changement climatique
- sciences naturelles sciences biologiques génétique génome
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
BN1 9RH Brighton
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.