Obiettivo
Planktonic eukaryotes are keystone players in the global carbon cycle, yet knowledge about their population diversity is late. This is not surprising since we are still actively investigating species richness, within these very diverse organisms. Phytoplankter are difficult to isolate and grow in the lab, so that direct analysis of their DNA sequence is the unique way to gain knowledge into their diversity and lifestyle. PICOPOP is about developing a population genomics approach, the analysis of the genetic variation between individuals from the same species at the genome level, to unravel intraspecific diversity in one model picophytoplanktonic species, Ostreococcus tauri, (OT). This approach has been successfully applied to species ranging from bakers’ yeast to humans, plants and insects. Knowledge about these population parameters is essential to gain insights into the species adaptive potential in response to environmental variation as climate change. OT provides an ideal model for the enclosed timely and feasible research proposal on intraspecific eukaryotic phytoplankton diversity because it is ubiquitous and the availability of a complete reference genome sequence. The JGI has recently accepted our project to sequence 20 complete genomes of OT strains isolated in the Mediterranean sea, using 454 technology. From an analytical point of view, research is late in the treatment of this new kind of data. PICOPOP thus assembles appropriate expertise of complementary partners (biologists, bioinformaticians and population geneticists) to adapt and develop the tools required throughout the analysis from raw 454 reads interpretation to analysis. Unicellular eukaryotic organisms represent much of the ocean’s reserve of biodiversity, and we expect that the results and methods developed in PICOPOP on a picophytoplanktonic model organism will both provide state of the art sequence analysis tools and shed light on the lifestyle and diversity of other planktonic species.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche ecologia ecosistemi
- scienze naturali scienze biologiche zoologia entomologia
- scienze naturali scienze della terra e scienze ambientali connesse scienze dell'atmosfera climatologia cambiamenti climatici
- scienze naturali scienze biologiche genetica genomi
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP7-PEOPLE-2009-IEF
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
BN1 9RH Brighton
Regno Unito
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.