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CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
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Contenu archivé le 2024-06-18

Structure and function of SMAT: a putative cellular decision-maker for transcription factor assembly

Objectif

Transcription factor IID (TFIID) is a key player in regulated transcription of eukaryotic genes by RNA polymerase II. The scaffold of TFIID is composed of a number of TATA-box binding protein-associated factors (TAFs), which are also found in other multimeric transcription factors (e.g. SAGA). An elaborate system of decision-making therefore must occur that directs the assembly of TAFs into either TFIID or SAGA or other TAF containing complexes. Recently, a multimeric 400 kDa small TAF-containing complex, SMAT, was discovered. SMAT is proposed to be a potent regulator of committed TFIID and SAGA assembly. The objective of this proposal is to elucidate the role of SMAT in eukaryotic gene regulation by means of an integrated, interdisciplinary approach combining structural, biochemical and in vivo cell biology methods. SMAT and its subcomplexes will be produced recombinantly by state-of-the-art eukaryotic expression techniques. Stable variants of SMAT core-complexes will be identified by a novel limited proteolysis/mass spectrometric approach and translated into expression experiments by utilizing an automated cloning platform technology. Intensive screening for growth of single, well diffracting crystals will be performed at the high-throughput crystallization facility at EMBL. By combining synchrotron X-ray crystallography, electron microscopy and small angle X-ray scattering experiments, a molecular model of SMAT will be obtained. Based on this model, point mutations will be designed, which specifically destabilize SMAT. Effects of the mutant proteins and of posttranslational modifications on the cellular decision-making process of TFIID or SAGA assembly, as well as SMAT integrity, will be assessed by in vivo functional assays in HeLa cells. The interdisciplinary nature of this project promises to contribute to the applicant’s career development by diversifying his competences and refining his skills ultimately guiding him towards an independent leading position.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

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Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2009-IEF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IEF - Intra-European Fellowships (IEF)

Coordinateur

EUROPEAN MOLECULAR BIOLOGY LABORATORY
Contribution de l’UE
€ 165 645,60
Adresse
Meyerhofstrasse 1
69117 Heidelberg
Allemagne

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Région
Baden-Württemberg Karlsruhe Heidelberg, Stadtkreis
Type d’activité
Research Organisations
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

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