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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Biomimetic nanopore for a mechanistic study of the nuclear pore complex

Obiettivo

Compartmentalization of the eukaryotic genome into a nucleus necessitates nuclear import and export to achieve basic cellular processes. The nuclear pore complex (NPC) is a large (60 - 125 MDa) macromolecular structure in eukaryotic cells, where it spans the nuclear membrane and serves as the gatekeeper of nucleocytoplasmic transport. While water, ions, and small molecules can freely diffuse through the NPC, macromolecules larger than 25 - 40 kDa cannot pass the NPC’s permeability barrier unless ferried by specific transport proteins called nuclear transport receptors (NTRs). While the structural arrangement and biochemistry of the complex have been largely worked out, the underlying mechanism of the pore’s transport and selectivity remains poorly understood. Mechanistic studies of the NPC have been largely carried out in vivo because in vitro reconstitution of the complex is not possible. Here, I propose to develop a biomimetic NPC-like system based on solid-state nanopore technology to conduct a real-time, single-molecule investigation into the mechanism of NPC transport and selectivity. Both electrical detection and a novel optical-electrical method will be used to monitor the translocation of individual substrates through a single biomimetic pore. The biomimetic approach proposed here will provide a significant step forward in experimentally studying the NPC, by affording an in vitro system that will allow for rigorous testing of key NPC proteins and their mechanistic role in transport and selectivity. This work will be carried out in the laboratory of Professor Cees Dekker, who is a world leader in nanofabrication and the application of solid-state nanopores to biology. My expertise in single-molecule biophysics, fluorescence microscopy, and biochemistry is well suited to complement the resources of the Dekker lab to collectively meet the interdisciplinary demands of this innovative effort.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

FP7-PEOPLE-2010-IIF
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

MC-IIF - International Incoming Fellowships (IIF)

Coordinatore

TECHNISCHE UNIVERSITEIT DELFT
Contributo UE
€ 185 540,80
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

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