Obiettivo
Chromatin is the ensemble of genomic DNA and hundreds of structural and regulatory proteins. Together these proteins govern the gene expression program of a cell. While biochemical and genetic approaches have tought us much about interactions between individual chromatin proteins, we still lack a “big picture” of chromatin: how is the entire interaction network of chromatin proteins organized?
My lab discovered that chromatin in Drosophila consists of a limited number of principal types that partition the genome into domains with distinct regulatory properties. Among these is BLACK chromatin, a novel repressive type of chromatin that covers nearly half of the fly genome. It is still largely unclear how these different chromatin types are formed, how they are targeted to specific genomic regions, and how they interact with each other.
Here, I propose a combination of systematic approaches aimed to gain insight into the basic mechanisms that drive the partioning of the genome into distinct chromatin types. New genomics techniques, developed in my laboratory, will be used to construct an integrated view of the interplay of more than one hundred representative chromatin proteins with each other and with sequence elements in the genome. Specifically, we will: (1) Study the genome-wide dynamic repositioning of chromatin domains during development in relation to gene regulation; (2) Use a novel and versatile parallel genome-wide reporter assay to dissect the interplay among DNA sequences and chromatin types; (3) Combine computational modeling with a high-throughput genome-wide assay to uncover the network of interactions responsible for the formation of the principal chromatin types; (4) Dissect the molecular architecture of BLACK chromatin and its role in gene repression.
The results will provide understanding of the basic principles that govern the structure and composition of chromatin, and reveal how the principal chromatin types together direct gene expression.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
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- scienze naturali scienze biologiche genetica DNA
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine
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Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
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ERC-2011-ADG_20110310
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Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Istituzione ospitante
1066 CX Amsterdam
Paesi Bassi
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.