Objetivo
The question of how the sequence of amino acids dictates the final fold of globular proteins remains one of the fundamental riddles of structural biology. The objective of the present research plan is to identify sequence elements that contribute key local and non-local interactions that are effective during the initial steps of the folding process.
A series of experiments are proposed to identify critical residues that form such effective interactions. Initial phases of the misfolding of globular and natively unfolded proteins will be explored in order to explain these processes and ultimately to control negative consequences of misfolding, e.g. formation of amyloid plaques. An interdisciplinary approach aimed primarily at structural characterization of the rapidly changing ensembles of partially folded protein molecules will be adopted. A number of methods will be applied, in particular time resolved FRET, -FRET detected FCS; FRET detected fast-kinetic methods, (a novel high pressure jump and micromixing based double kinetics experiments); protein engineering and computational methods.
The hypothesis is that few very effective non-local contacts can direct the backbone into a native like fold at the early phase of the folding transition. This hypothesis will be explored to identify the essential key interactions and specific clusters of residues that contribute to those interactions. The response of the ensembles of conformers to changes of pressure; temperature; solvent composition and to the insertion of structure perturbation mutations will be monitored. Computational and bioinformatics methods will be applied in an attempt to generalize the experimental results.
In order to achieve these goals the host research group will bring in
- methods for construction of a pressure -jump and micromixing devices;
- methods of molecular dynamics simulations, and
- the technology enabling single molecule detection.
Ámbito científico (EuroSciVoc)
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
CORDIS clasifica los proyectos con EuroSciVoc, una taxonomía plurilingüe de ámbitos científicos, mediante un proceso semiautomático basado en técnicas de procesamiento del lenguaje natural. Véas: El vocabulario científico europeo..
- ciencias naturales ciencias biológicas bioquímica biomoléculas proteínas plegamiento de proteínas
- ciencias naturales ciencias biológicas genética mutación
- ciencias naturales ciencias físicas mecánica clásica mecánica de fluidos estática de fluidos
- ciencias naturales ciencias químicas química orgánica aminas
- ciencias naturales ciencias físicas óptica física del láser
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Palabras clave
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Palabras clave del proyecto indicadas por el coordinador del proyecto. No confundir con la taxonomía EuroSciVoc (Ámbito científico).
Programa(s)
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Programas de financiación plurianuales que definen las prioridades de la UE en materia de investigación e innovación.
Tema(s)
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Las convocatorias de propuestas se dividen en temas. Un tema define una materia o área específica para la que los solicitantes pueden presentar propuestas. La descripción de un tema comprende su alcance específico y la repercusión prevista del proyecto financiado.
Convocatoria de propuestas
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
Procedimiento para invitar a los solicitantes a presentar propuestas de proyectos con el objetivo de obtener financiación de la UE.
FP6-2004-MOBILITY-3
Consulte otros proyectos de esta convocatoria
Régimen de financiación
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Régimen de financiación (o «Tipo de acción») dentro de un programa con características comunes. Especifica: el alcance de lo que se financia; el porcentaje de reembolso; los criterios específicos de evaluación para optar a la financiación; y el uso de formas simplificadas de costes como los importes a tanto alzado.
Coordinador
RAMAT GAN
Israel
Los costes totales en que ha incurrido esta organización para participar en el proyecto, incluidos los costes directos e indirectos. Este importe es un subconjunto del presupuesto total del proyecto.