Obiettivo
The question of how the sequence of amino acids dictates the final fold of globular proteins remains one of the fundamental riddles of structural biology. The objective of the present research plan is to identify sequence elements that contribute key local and non-local interactions that are effective during the initial steps of the folding process.
A series of experiments are proposed to identify critical residues that form such effective interactions. Initial phases of the misfolding of globular and natively unfolded proteins will be explored in order to explain these processes and ultimately to control negative consequences of misfolding, e.g. formation of amyloid plaques. An interdisciplinary approach aimed primarily at structural characterization of the rapidly changing ensembles of partially folded protein molecules will be adopted. A number of methods will be applied, in particular time resolved FRET, -FRET detected FCS; FRET detected fast-kinetic methods, (a novel high pressure jump and micromixing based double kinetics experiments); protein engineering and computational methods.
The hypothesis is that few very effective non-local contacts can direct the backbone into a native like fold at the early phase of the folding transition. This hypothesis will be explored to identify the essential key interactions and specific clusters of residues that contribute to those interactions. The response of the ensembles of conformers to changes of pressure; temperature; solvent composition and to the insertion of structure perturbation mutations will be monitored. Computational and bioinformatics methods will be applied in an attempt to generalize the experimental results.
In order to achieve these goals the host research group will bring in
- methods for construction of a pressure -jump and micromixing devices;
- methods of molecular dynamics simulations, and
- the technology enabling single molecule detection.
Campo scientifico (EuroSciVoc)
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.
- scienze naturali scienze biologiche biochimica biomolecole proteine ripiegamento proteico
- scienze naturali scienze biologiche genetica mutazione
- scienze naturali scienze fisiche meccanica classica meccanica dei fluidi statica dei fluidi
- scienze naturali scienze chimiche chimica organica ammine
- scienze naturali scienze fisiche ottica fisica dei laser
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Parole chiave
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Parole chiave del progetto, indicate dal coordinatore del progetto. Da non confondere con la tassonomia EuroSciVoc (campo scientifico).
Programma(i)
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Programmi di finanziamento pluriennali che definiscono le priorità dell’UE in materia di ricerca e innovazione.
Argomento(i)
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.
Invito a presentare proposte
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.
FP6-2004-MOBILITY-3
Vedi altri progetti per questo bando
Meccanismo di finanziamento
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.
Coordinatore
RAMAT GAN
Israele
I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.