Ziel
The question of how the sequence of amino acids dictates the final fold of globular proteins remains one of the fundamental riddles of structural biology. The objective of the present research plan is to identify sequence elements that contribute key local and non-local interactions that are effective during the initial steps of the folding process.
A series of experiments are proposed to identify critical residues that form such effective interactions. Initial phases of the misfolding of globular and natively unfolded proteins will be explored in order to explain these processes and ultimately to control negative consequences of misfolding, e.g. formation of amyloid plaques. An interdisciplinary approach aimed primarily at structural characterization of the rapidly changing ensembles of partially folded protein molecules will be adopted. A number of methods will be applied, in particular time resolved FRET, -FRET detected FCS; FRET detected fast-kinetic methods, (a novel high pressure jump and micromixing based double kinetics experiments); protein engineering and computational methods.
The hypothesis is that few very effective non-local contacts can direct the backbone into a native like fold at the early phase of the folding transition. This hypothesis will be explored to identify the essential key interactions and specific clusters of residues that contribute to those interactions. The response of the ensembles of conformers to changes of pressure; temperature; solvent composition and to the insertion of structure perturbation mutations will be monitored. Computational and bioinformatics methods will be applied in an attempt to generalize the experimental results.
In order to achieve these goals the host research group will bring in
- methods for construction of a pressure -jump and micromixing devices;
- methods of molecular dynamics simulations, and
- the technology enabling single molecule detection.
Wissenschaftliches Gebiet (EuroSciVoc)
CORDIS klassifiziert Projekte mit EuroSciVoc, einer mehrsprachigen Taxonomie der Wissenschaftsbereiche, durch einen halbautomatischen Prozess, der auf Verfahren der Verarbeitung natürlicher Sprache beruht. Siehe: Das European Science Vocabulary.
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- Naturwissenschaften Biowissenschaften Biochemie Biomoleküle Proteine Proteinfaltung
- Naturwissenschaften Biowissenschaften Genetik Mutation
- Naturwissenschaften Naturwissenschaften klassische Mechanik Strömungsmechanik Hydrostatik
- Naturwissenschaften Chemiewissenschaften organische Chemie Amine
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Schlüsselbegriffe
Schlüsselbegriffe des Projekts, wie vom Projektkoordinator angegeben. Nicht zu verwechseln mit der EuroSciVoc-Taxonomie (Wissenschaftliches Gebiet).
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Programm/Programme
Mehrjährige Finanzierungsprogramme, in denen die Prioritäten der EU für Forschung und Innovation festgelegt sind.
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Thema/Themen
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderungen zur Einreichung von Vorschlägen sind nach Themen gegliedert. Ein Thema definiert einen bestimmten Bereich oder ein Gebiet, zu dem Vorschläge eingereicht werden können. Die Beschreibung eines Themas umfasst seinen spezifischen Umfang und die erwarteten Auswirkungen des finanzierten Projekts.
Aufforderung zur Vorschlagseinreichung
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
Verfahren zur Aufforderung zur Einreichung von Projektvorschlägen mit dem Ziel, eine EU-Finanzierung zu erhalten.
FP6-2004-MOBILITY-3
Andere Projekte für diesen Aufruf anzeigen
Finanzierungsplan
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Finanzierungsregelung (oder „Art der Maßnahme“) innerhalb eines Programms mit gemeinsamen Merkmalen. Sieht folgendes vor: den Umfang der finanzierten Maßnahmen, den Erstattungssatz, spezifische Bewertungskriterien für die Finanzierung und die Verwendung vereinfachter Kostenformen wie Pauschalbeträge.
Koordinator
RAMAT GAN
Israel
Die Gesamtkosten, die dieser Organisation durch die Beteiligung am Projekt entstanden sind, einschließlich der direkten und indirekten Kosten. Dieser Betrag ist Teil des Gesamtbudgets des Projekts.