Objectif
Rheumatoid Arthritis (RA) and Crohn’s disease (CD) are two common chronic autoimmune and complex diseases where individual susceptibility is determined by a combination of environmental and genetic factors. Almost all of the ~100 risk alleles discovered through recent genetic studies fall in non-coding region and have an elusive function. We hypothesize that risk alleles impact gene regulation by altering regulatory elements (e.g. enhancers) controlling the expression levels of genes within the same pathogenic pathway. The cell-specific variation in regulatory element (RE) activity can be identified by assaying histone modifications which correlate with chromatin states and DNA accessibility. Recently, assaying these histone modifications has become possible with ChiP seq methods, which applies high-throughput sequencing to identify genomic segments bound to antibodies to specific histone modifications. However to identify the REs impacted by risk loci, it is first necessary to determine the cells type (CT) affected by these risk loci; these cell types are not obvious in autoimmune diseases. Exploiting data on genome-wide histone marks in a library of immune-CT, we will develop a statistical method to identify the likely key pathogenic cells type by looking for immune-CTs specifically enriched in active REs containing risk loci. Subsequently, we will develop an approach to determine the cell specific REs impacted by risk loci and establish putative regulatory variant within of REs and associated with these complex disorders. I will develop this approach in my Outgoing Host Institute (Harvard Medical School) using RA as model, and will then apply it to CD in my Return Host Institute (University of Liege) where I pursue my research on the effect of regulatory risk alleles on the cell specific gene expression. This proposal will allow the discovery of new drug targets that can ultimately result in novel specific therapies for RA and CD patients.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences médicales et de la santé médecine clinique rhumatologie
- sciences naturelles sciences biologiques génétique ADN
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale immunologie maladies auto-immunes
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2011-IOF
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Coordinateur
4000 LIEGE
Belgique
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.