Skip to main content
Aller à la page d’accueil de la Commission européenne (s’ouvre dans une nouvelle fenêtre)
français français
CORDIS - Résultats de la recherche de l’UE
CORDIS
Contenu archivé le 2024-06-18

Metacommunity dynamics of the fish surface mircobiome in health and disease: pathogens and probiotics

Objectif

Wild fish stocks are coming under strain as the demand for cheap sources of protein increases. As a result, aquaculture has expanded to an industrial scale and now accounts for over a third of total fisheries production. The exceptional conditions farming imposes on commercial fish species is driving the emergence of new and more virulent bacterial pathogens, with huge associated economic losses to the sector. Correspondingly, antiobiotic use in aquaculture is widespread. Antibiotic resistance in fish pathogens is also now common. Indiscriminate antibiotic use contaminates the consumer food chain, threatens human populations via the lateral transfer of resistance genotypes to human pathogens, and ultimately reduces the effectiveness of these drugs in a clinical and veterinary context. Thus, there is an urgent need to limit the use of antibiotics in aquaculture and to find alternative strategies to treat outbreaks of bacterial disease. In this proposal the opportunistic bacterial pathogen F. columnaris is the target of study. This organism causes fatal skin disease in a range of freshwater fish species including catfish and salmonids. At Laval University, Quebec a unique in vivo model of this disease is in place - the Brook Charr. Furthermore, at Laval an effective in vivo probiotic comprised of four endogenous skin bacteria has just been developed. We propose to use next generation pyrosequencing to profile the surface microbiome of this fish in health and disease. Furthermore, we propose to use in vitro competition assays between probiotics and pathogen, in combination with Illimuna sequencing, to study the metatranscriptomics of a model antagonistic ecological interaction. Drawing on expertise at the Universite de Laval, as well as that at the world class Marine Ecology and Fisheries Genetic Laboratory, UK, this proposal will establish the molecular basis for this probiotic effect to inform the development of similar approaches in other diseases and fish species.

Champ scientifique (EuroSciVoc)

CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.

Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction

Programme(s)

Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.

Thème(s)

Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.

Appel à propositions

Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.

FP7-PEOPLE-2011-IOF
Voir d’autres projets de cet appel

Régime de financement

Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.

MC-IOF - International Outgoing Fellowships (IOF)

Coordinateur

BANGOR UNIVERSITY
Contribution de l’UE
€ 248 220,90
Adresse
COLLEGE ROAD
LL57 2DG Bangor
Royaume-Uni

Voir sur la carte

Région
Wales West Wales and The Valleys Gwynedd
Type d’activité
Higher or Secondary Education Establishments
Liens
Coût total

Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.

Aucune donnée
Mon livret 0 0