Objectif
Computational modelling is changing the face of science. Many complex systems can be understood as embodied computational systems performing distributed computations on a massive scale. Biology is the discipline where these ideas find their most natural application: cells can be viewed as input/ output devices, with proteins and organelles behaving as finite state machines performing distributed computations inside the cell. This led to the influential framework of cell as computation, and the successful deployment of formal verification and analysis on models of biological systems.
This paradigm shift in our understanding of biology has been possible due to the increasingly quantitative experimental techniques being developed in experimental biology. Formal modelling techniques, however, do not have mechanisms to directly include the information obtained from experimental observations in a statistically consistent way. This difficulty in relating the experimental and theoretical developments in biology is a central problem: without incorporating observations, it is extremely difficult to obtain reliable parametrisations of models. More importantly, it is impossible to assess the confidence of model predictions. This means that the central scientific task of falsifying hypotheses cannot be performed in a statistically meaningful way, and that it is very difficult to employ model predictions to rationally plan novel experiments.
In this project we will build and develop machine learning tools for continuous time stochastic processes to obtain a principled treatment of the uncertainty at every step of the modelling pipeline. We will use and extend probabilistic programming languages to fully automate the inference tasks, and link to advanced modelling languages to allow formal analysis tools to be deployed in a data modelling framework. We will pursue twoapplications to fundamental problems in systems biology, guaranteeing impact on exciting scientific questions.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
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- sciences naturelles informatique et science de l'information logiciel
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2012-StG_20111012
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
EH8 9YL Edinburgh
Royaume-Uni
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.