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Contenuto archiviato il 2024-06-18

Machine learning for computational science:<br/>statistical and formal modelling of biological systems

Obiettivo

Computational modelling is changing the face of science. Many complex systems can be understood as embodied computational systems performing distributed computations on a massive scale. Biology is the discipline where these ideas find their most natural application: cells can be viewed as input/ output devices, with proteins and organelles behaving as finite state machines performing distributed computations inside the cell. This led to the influential framework of cell as computation, and the successful deployment of formal verification and analysis on models of biological systems.

This paradigm shift in our understanding of biology has been possible due to the increasingly quantitative experimental techniques being developed in experimental biology. Formal modelling techniques, however, do not have mechanisms to directly include the information obtained from experimental observations in a statistically consistent way. This difficulty in relating the experimental and theoretical developments in biology is a central problem: without incorporating observations, it is extremely difficult to obtain reliable parametrisations of models. More importantly, it is impossible to assess the confidence of model predictions. This means that the central scientific task of falsifying hypotheses cannot be performed in a statistically meaningful way, and that it is very difficult to employ model predictions to rationally plan novel experiments.

In this project we will build and develop machine learning tools for continuous time stochastic processes to obtain a principled treatment of the uncertainty at every step of the modelling pipeline. We will use and extend probabilistic programming languages to fully automate the inference tasks, and link to advanced modelling languages to allow formal analysis tools to be deployed in a data modelling framework. We will pursue twoapplications to fundamental problems in systems biology, guaranteeing impact on exciting scientific questions.

Campo scientifico (EuroSciVoc)

CORDIS classifica i progetti con EuroSciVoc, una tassonomia multilingue dei campi scientifici, attraverso un processo semi-automatico basato su tecniche NLP. Cfr.: Il Vocabolario Scientifico Europeo.

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Argomento(i)

Gli inviti a presentare proposte sono suddivisi per argomenti. Un argomento definisce un’area o un tema specifico per il quale i candidati possono presentare proposte. La descrizione di un argomento comprende il suo ambito specifico e l’impatto previsto del progetto finanziato.

Invito a presentare proposte

Procedura per invitare i candidati a presentare proposte di progetti, con l’obiettivo di ricevere finanziamenti dall’UE.

ERC-2012-StG_20111012
Vedi altri progetti per questo bando

Meccanismo di finanziamento

Meccanismo di finanziamento (o «Tipo di azione») all’interno di un programma con caratteristiche comuni. Specifica: l’ambito di ciò che viene finanziato; il tasso di rimborso; i criteri di valutazione specifici per qualificarsi per il finanziamento; l’uso di forme semplificate di costi come gli importi forfettari.

ERC-SG - ERC Starting Grant

Istituzione ospitante

THE UNIVERSITY OF EDINBURGH
Contributo UE
€ 1 421 944,00
Indirizzo
OLD COLLEGE, SOUTH BRIDGE
EH8 9YL Edinburgh
Regno Unito

Mostra sulla mappa

Regione
Scotland Eastern Scotland Edinburgh
Tipo di attività
Higher or Secondary Education Establishments
Collegamenti
Costo totale

I costi totali sostenuti dall’organizzazione per partecipare al progetto, compresi i costi diretti e indiretti. Questo importo è un sottoinsieme del bilancio complessivo del progetto.

Nessun dato

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