Objectif
Multidrug-resistant bacteria are a global threat to public health and the economy. Studies in model organisms suggest compensatory evolution and epistatic interactions between drug resistance-conferring mutations are important drivers of drug resistance. However, the relevance of these factors for the emergence and transmission of human pathogenic bacteria has not been established. To bridge the gap between laboratory experimentation and epidemiology, I propose a multidisciplinary approach focusing on Mycobacterium tuberculosis, the etiologic agent of human tuberculosis (TB). Specifically, I shall combine experimental evolution and fitness assays in vitro and in human macrophages with comparative genome sequencing, RNAseq-based transcriptomics, and population-based molecular epidemiology to:
1) Identify and characterize compensatory mutations in M. tuberculosis resistant to rifampicin, streptomycin, and ofloxacin;
2) Detect epistasis between drug resistance-conferring mutations in different strain genetic backgrounds;
3) Investigate the effect of drug resistance-conferring mutations, compensatory mutations, and their epistatic interactions on the M. tuberculosis transcriptome.
The strength of my approach lies in the integration of an experimentally tractable model system (Mycobacterium smegmatis) with targeted validation experiments in clinically relevant M. tuberculosis, and comprehensive molecular epidemiological data collected prospectively in Georgia, a country with a high-burden of multidrug-resistant TB.
Through its multidisciplinary nature, this project will simultaneously test predictions from ecological theory and experimental models, generate new insights into the biology and epidemiology of multidrug-resistant TB, and ultimately contribute to the control of one of humankind’s most important infectious diseases.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: https://op.europa.eu/fr/web/eu-vocabularies/euroscivoc.
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- sciences médicales et de la santé sciences de la santé santé publique et environnementale épidémiologie
- sciences médicales et de la santé sciences de la santé maladie infectieuse
- sciences médicales et de la santé médecine fondamentale pharmacologie et pharmacie résistance aux médicaments
- sciences médicales et de la santé médecine clinique pneumologie tuberculose
- sciences naturelles sciences biologiques génétique mutation
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Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
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Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
ERC-2012-StG_20111109
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Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Institution d’accueil
4123 ALLSCHWIL
Suisse
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.