Objectif
The two most fundamental features of molecular recognition are affinity and specificity. The proposed research aims to develop a new methodology for de novo design of small interaction networks not seen in Nature and to generate such networks with predetermined levels of specificity and affinity. In Preliminary Results we developed a methodology to de novo design protein binders of surfaces that have not been structurally characterized in bound form. We used this method to design three experimentally validated medium-affinity binders of the apo form of an acyl carrier protein (ACP), which has no co-crystal structures, demonstrating that interaction design could target a broad range of physicochemically appropriate surfaces. This synthetic network is the first multispecific system (one ACP interacts with three unrelated proteins), which is completely devoid of selective pressures for function other than binding, and will serve as a model to study how high affinity, specificity, and multispecificity might arise from non-interacting proteins. We will develop a multidisciplinary computational/experimental approach to substantially increase the affinity of the ACP to its binders by introducing stabilizing substitutions to residues on either one or both sides of each designed interface. Affinity will be further increased by experimental in vitro selection of higher-affinity variants of the ACP or of its partners. We will additionally erect specificity barriers between the ACP-binder pairs by redesigning the amino acid identities and backbones of interfacial loops. Specificity and affinity are important features in many protein-engineering applications, including the development of protein therapeutics and diagnostics, and the generation of synthetic signaling and metabolic networks. Small networks, such as the ones we produce here, may be future building blocks in these applications.
Champ scientifique (EuroSciVoc)
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
CORDIS classe les projets avec EuroSciVoc, une taxonomie multilingue des domaines scientifiques, grâce à un processus semi-automatique basé sur des techniques TLN. Voir: Le vocabulaire scientifique européen.
- sciences naturelles sciences biologiques biochimie biomolécule protéines
- sciences naturelles sciences chimiques chimie organique amines
Vous devez vous identifier ou vous inscrire pour utiliser cette fonction
Nous sommes désolés... Une erreur inattendue s’est produite.
Vous devez être authentifié. Votre session a peut-être expiré.
Merci pour votre retour d'information. Vous recevrez bientôt un courriel confirmant la soumission. Si vous avez choisi d'être informé de l'état de la déclaration, vous serez également contacté lorsque celui-ci évoluera.
Programme(s)
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Programmes de financement pluriannuels qui définissent les priorités de l’UE en matière de recherche et d’innovation.
Thème(s)
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Les appels à propositions sont divisés en thèmes. Un thème définit un sujet ou un domaine spécifique dans le cadre duquel les candidats peuvent soumettre des propositions. La description d’un thème comprend sa portée spécifique et l’impact attendu du projet financé.
Appel à propositions
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
Procédure par laquelle les candidats sont invités à soumettre des propositions de projet en vue de bénéficier d’un financement de l’UE.
FP7-PEOPLE-2012-CIG
Voir d’autres projets de cet appel
Régime de financement
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
Régime de financement (ou «type d’action») à l’intérieur d’un programme présentant des caractéristiques communes. Le régime de financement précise le champ d’application de ce qui est financé, le taux de remboursement, les critères d’évaluation spécifiques pour bénéficier du financement et les formes simplifiées de couverture des coûts, telles que les montants forfaitaires.
MC-CIG - Support for training and career development of researcher (CIG)
Coordinateur
7610001 Rehovot
Israël
Les coûts totaux encourus par l’organisation concernée pour participer au projet, y compris les coûts directs et indirects. Ce montant est un sous-ensemble du budget global du projet.